[发明专利]一种丝状微生物的染色方法及其用途在审
申请号: | 202110273564.2 | 申请日: | 2017-12-29 |
公开(公告)号: | CN113155578A | 公开(公告)日: | 2021-07-23 |
发明(设计)人: | 明磊强;张大海;杨宗霖;史雅琦 | 申请(专利权)人: | 乔治洛德方法研究和开发液化空气有限公司 |
主分类号: | G01N1/30 | 分类号: | G01N1/30;G01N21/64;G06K9/00 |
代理公司: | 北京市中咨律师事务所 11247 | 代理人: | 张莉;林柏楠 |
地址: | 法国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 丝状 微生物 染色 方法 及其 用途 | ||
1.一种图像处理方法,包括如下步骤:
(2)高斯滤波处理;
(3)Canny边缘检测;
(4)均值滤波处理,优选为圆形均值滤波处理;
(5)主成分分析,去掉非线性结构的边缘,
所述图像处理方法任选包括(1)目标照片的输入;和/或(6)输出只包含菌丝的图像,并且统计亮点的个数。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于:
步骤(2)中对输入图像进行一次平滑,并把黑白图片二值化;
步骤(3)中得到图片的梯度,寻找梯度的极大值点并把这些极大值点连起来;
步骤(4)中将照片中的孤立点、菌体与菌丝分离开,去掉孤立点的点和菌体的点,
优选如下去掉孤立点的点和菌体的点:
(i)采用均值滤波,用每个点周围的平均亮度代替该点原来的亮度;
(ii)设定一个上阈值和一个下阈值,亮度小于下阈值的认为是孤立点的信号,亮度大于上阈值的认为是菌体的信号;
(iii)去掉图像中孤立的点和菌体的点;
进一步优选其中上阈值为大约0.20,下阈值为大约0.064;
步骤(5)中如下去掉非线性结构的边缘:
(i)寻找一个像素点周边的8个像素点范围内所有的亮点,优选寻找所述像素点周边的16个像素点范围内所有的亮点;
(ii)确定亮点在图像中的位置,对这些亮点的坐标做PCA(主成分分析),通过PCA两个特征值的比值,获知所述点邻域的线性结构强度;
(iii)设定阈值为0-1,去掉线性结构不够强的点,优选设定阈值为0.2-0.5;
步骤(6)中通过统计所有剩余亮点的个数,完成菌丝长度的统计。
3.一种电子设备,包括显示器、一个或多个处理器及存储器,其特征在于所述存储器存储有程序,并且被配置成由所述一个或多个处理器执行权利要要求1或2中的步骤,
其中所述存储器包括以下程序模块:
(b)用于高斯滤波处理的程序模块;
(c)用于含Canny边缘检测的程序模块;
(d)用于通过均值滤波处理的程序模块,优选用于通过圆形均值滤波处理的程序模块;
(e)用于通过主成分分析,去掉非线性结构的边缘的程序模块,
任选包括(a)用于目标照片输入的程序模块;和(f)用于通过输出只包含菌丝的图像,并且统计亮点的个数数据的程序模块。
4.一种计算机可读存储介质,包括与权利要求3所述的电子设备结合使用的程序,其特征在于所述程序可被处理器执行以完成权利要求1或2中的步骤。
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