[发明专利]改良高盐-低pH法提取灯盏细辛叶绿体基因组DNA的方法有效
| 申请号: | 202110223657.4 | 申请日: | 2021-03-01 |
| 公开(公告)号: | CN114990103B | 公开(公告)日: | 2023-08-25 |
| 发明(设计)人: | 黄璐琦;赵瑜君;郭娟;于一凡 | 申请(专利权)人: | 中国中医科学院中药研究所 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
| 地址: | 100700 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 改良 ph 提取 灯盏 细辛 叶绿体 基因组 dna 方法 | ||
1.一种灯盏细辛叶绿体基因组DNA的提取方法,包括如下步骤:
(1)叶绿体分离:将经饥饿处理的灯盏细辛叶片加入缓冲液A中进行匀浆,过滤,收集滤液;对所述滤液进行第一次离心,收集上清液;对所述上清液进行第二次离心,收集绿色沉淀,得到粗叶绿体;
步骤(1)中,所述灯盏细辛叶片与所述缓冲液A的比例为20g:60~100mL;
所述缓冲液A的pH值为3.8;所述缓冲液A由下述组分组成:1.25mol/L NaCl,0.25mol/L抗坏血酸,10mmol/L焦亚硫酸钠,50mmol/L pH值为8.0的Tris-HCl,7mmol/L pH值为8.0的EDTA,1%w/v PVP-40,0.1%w/v牛血清白蛋白,1mmol/L二硫苏糖醇和余量的水;
步骤(1)中,所述第一次离心的离心力为500×g,时间为10~20min;
所述第二次离心的离心力为2500×g,时间为12min;
(2)叶绿体纯化:在步骤(1)得到的粗叶绿体中加入缓冲液B,轻悬,离心,收集沉淀,得到叶绿体;
步骤(2)中,所述缓冲液B的pH值为8.0;所述缓冲液B由下述组分组成:1.25mol/LNaCl,50mmol/L pH值为8.0的Tris-HCl,25mmol/L pH值为8.0的EDTA,1%w/v PVP-40,0.1%w/v牛血清白蛋白,1mmol/L二硫苏糖醇和余量的水;
步骤(2)中,所述离心的离心力为2500×g,时间为12min;
(3)叶绿体裂解:在步骤(2)得到的叶绿体中加入缓冲液C,再加入蛋白酶进行温育,冷却;
步骤(3)中,所述缓冲液C的pH值为8.0;所述缓冲液C由下述组分组成:50mmol/L Tris-HCl,25mmol/L pH值为8.0的EDTA,1.25mol/L NaCl,2.0%十二烷基硫酸钠和余量的水;
(4)叶绿体DNA的提取:从步骤(3)裂解后的体系中提取叶绿体DNA,得到所述叶绿体基因组DNA。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(4)中,所述提取的步骤如下:采用溶剂Ⅰ对步骤(3)裂解后的体系进行抽提,混匀后进行第一次离心,收集上清液,得上清液Ⅰ;
在所述上清液Ⅰ中加入溶剂Ⅱ进行第二次离心,收集上清液,得上清液Ⅱ;
在所述上清液Ⅱ中加入溶剂Ⅲ,混匀后沉降,进行第三次离心,收集沉淀,得到所述叶绿体基因组DNA。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于:步骤(4)中,所述裂解后的体系与所述溶剂Ⅰ的体积相等;所述溶剂Ⅰ由体积比为25:24:1的苯酚、氯仿和异戊醇组成;所述第一次离心的离心力为10000~12000×g,时间为10~20min;
所述上清液Ⅰ与所述溶剂Ⅱ的体积相等;所述溶剂Ⅱ由体积比为24:1氯仿和异戊醇组成;所述第二次离心的离心力为10000~12000×g,时间为10~20min;
所述上清液Ⅱ与所述溶剂Ⅲ的体积相等;所述溶剂Ⅲ为异丙醇;所述第三次离心的转速为10000~12000×g,时间为20~30min。
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