[发明专利]用于表征肽：MHC结合多肽的方法

权利要求书

1.用于表征包含至少一个定义肽结合结构域的多肽分子(“pMHC结合多肽”)与肽：MHC复合体的肽(“靶肽”)结合的方法，其包括

a)提供包含至少一种肽：MHC复合体的待分析样本，

b)使所述样本与所述多肽分子(“pMHC结合多肽”)接触，并允许所述多肽分子的所述至少一个肽结合结构域与所述至少一种肽：MHC复合体结合，

c)分离与所述至少一个肽结合结构域结合的所述至少一种肽：MHC复合体，和

d)鉴定按步骤c)中所分离的所述至少一种肽：MHC复合体的所述肽，从而鉴定所述多肽分子与所述至少一种肽：MHC复合体的所述肽的结合。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述多肽分子任选地附着于基质材料，和/或其中所述多肽分子进一步包含至少一个与基质材料结合或与之附着的附着位点。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于，表征多肽分子与肽：MHC复合体的肽的结合包括鉴定多肽分子与肽：MHC复合体的所述肽结合。

4.根据权利要求1至3任一项中所述的方法，其中，所述样本选自包含至少一种肽：MHC复合体的天然或人工样本(例如，细胞裂解物)，或包含纯化或富集的肽：MHC复合体的样本。

5.根据权利要求1至4任一项中所述的方法，其特征在于，包含所述至少一个肽结合结构域的所述多肽分子选自双特异性、三特异性、四特异性或多特异性分子。

6.根据权利要求1至5任一项中所述的方法，其特征在于，包含所述至少一个肽结合结构域的所述多肽分子为选自以下的分子，或衍生自选自以下的分子：抗体、同时多重相互作用T细胞衔接(SMITE)双特异性分子、双特异性T细胞衔接分子(BiTE)、scFV、双抗体、双重亲和力重靶向抗体(DART)、串联抗体(TandAb)、可溶性TCR、scTCR、突变TCR(例如包含S桥)、截短TCR和双特异性T细胞受体(TCR)-抗体融合分子。

7.根据权利要求1至6任一项中所述的方法，其特征在于，所述多肽分子包含至少一个第二结合结构域，该第二结合结构域选自与已知诱导免疫细胞激活的细胞表面分子以及免疫反应相关分子结合的结构域，优选为与CD3或其一个链(例如：CD3γ、CD3δ和CD3ε链)、CD4、CD7、CD8、CD10、CD11b、CD11c、CD14、CD16、CD18、CD22、CD25、CD28、CD32a、CD32b、CD33、CD41、CD41b、CD42a、CD42b、CD44、CD45RA、CD49、CD55、CD56、CD61、CD64、CD68、CD94、CD90、CD117、CD123、CD125、CD134、CD137、CD152、CD163、CD193、CD203c、CD235a、CD278、CD279、CD287、Nkp46、NKG2D、GITR、FcεRI、TCRα/β、TCRγ/δ和/或HLA-DR结合的第二结合结构域。

8.根据权利要求1至7任一项中所述的方法，其特征在于，包含所述至少一个肽结合结构域的所述多肽分子是包含衍生自T细胞受体(TCR)的肽结合结构域的双特异性分子。

9.根据权利要求1至8任一项所述的方法，其特征在于，包含所述至少一个肽结合结构域的所述多肽分子为可溶性分子。

10.根据权利要求2至9任一项中所述的方法，其特征在于，所述附着位点位于至少一个结合结构域、至少一个第二结构域或为单独的附着基团，并且基本上不干扰所述分子的结合。

11.根据权利要求1至10任一项中所述的方法，其特征在于，步骤d)中的所述鉴定包括选自质谱分析和肽测序的方法。

12.根据权利要求1至11任一项中所述的方法，其特征在于，表征多肽分子与肽：MHC复合体的肽的结合包括鉴定所述肽：MHC结合结构域的上位结合基序。