[发明专利]基于GC-MS建立分子网络的方法及其应用在审
| 申请号: | 202011489780.2 | 申请日: | 2020-12-16 |
| 公开(公告)号: | CN112530527A | 公开(公告)日: | 2021-03-19 |
| 发明(设计)人: | 叶烨;李东亮 | 申请(专利权)人: | 四川中烟工业有限责任公司 |
| 主分类号: | G16C20/20 | 分类号: | G16C20/20;G16C20/70;G16C20/80 |
| 代理公司: | 四川省成都市天策商标专利事务所 51213 | 代理人: | 龚海月 |
| 地址: | 610000 四川省成都市龙泉*** | 国省代码: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 gc ms 建立 分子 网络 方法 及其 应用 | ||
1.一种基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)GC-MS分析与原始数据采集;
(2)使用MSconvert软件将原始数据转换成mzXML格式;
(3)采用ADAP对原始数据进行处理,构建提取的离子色谱图EICs,并检测色谱峰;
(4)利用光谱反褶积对色谱图进行比对和层次聚类;
(5)生成.mgf文件和.csv文件;
(6)用MetGem软件打开步骤(5)的.mgf文件和.csv文件,形成分子网络;
(7)使用可视化软件,进行分子网络图编辑。
2.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,步骤(1)中的GC-MS分析,质谱条件为EI源,并采用全扫模式。
3.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,步骤(3)中ADAP对原始数据进行处理时,参数设置为:信噪比为5-8,最小峰高为100-2000,系数阈值为50-100,峰漂移时间范围为0-0.5分钟,保留时间漂移范围为0-0.5分钟。
4.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,步骤(4)中的光谱反褶积对色谱图进行比对和层次聚类采用RANSAC算法。
5.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,步骤(5)中生成.mgf文件和.csv文件中,.mgf文件包括所有的色谱和质谱数据,.csv文件作为元数据信息,包括峰面积、峰强度、保留时间和基峰信号。
6.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,步骤(6)中所述的MetGem软件形成分子网络,包括以下设置:EI-MS光谱通过选择整个光谱中±50Da的前6个峰进行过滤;使用m/z误差在0.3Th计算余弦值;创建的分子网络,设置边缘过滤条件为:余弦值大于0.7和超过六个匹配的峰。
7.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,步骤(7)中所述的可视化软件为Cytoscape,进行分子网络图编辑具体包括:
为每个样本分配不同的颜色,以峰面积大小为含量,生成饼状图;设置edge余弦值为0.7。
8.根据权利要求1-7任一项所述的基于GC-MS建立分子网络的方法的应用,其特征在于,利用所述的方法建立分子结构特征组群,可用于不同来源、不同加工工艺的香原料或香精的真伪甄别,以及差异性比较。
9.根据权利要求1-7任一项所述的基于GC-MS建立分子网络的方法的应用,其特征在于,利用所述的方法建立分子结构特征组群,可用于香原料靶向组分的开发与鉴定。
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