[发明专利]基于GC-MS建立分子网络的方法及其应用在审

专利信息
申请号: 202011489780.2 申请日: 2020-12-16
公开(公告)号: CN112530527A 公开(公告)日: 2021-03-19
发明(设计)人: 叶烨;李东亮 申请(专利权)人: 四川中烟工业有限责任公司
主分类号: G16C20/20 分类号: G16C20/20;G16C20/70;G16C20/80
代理公司: 四川省成都市天策商标专利事务所 51213 代理人: 龚海月
地址: 610000 四川省成都市龙泉*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 基于 gc ms 建立 分子 网络 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)GC-MS分析与原始数据采集;

(2)使用MSconvert软件将原始数据转换成mzXML格式;

(3)采用ADAP对原始数据进行处理,构建提取的离子色谱图EICs,并检测色谱峰;

(4)利用光谱反褶积对色谱图进行比对和层次聚类;

(5)生成.mgf文件和.csv文件;

(6)用MetGem软件打开步骤(5)的.mgf文件和.csv文件,形成分子网络;

(7)使用可视化软件,进行分子网络图编辑。

2.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,步骤(1)中的GC-MS分析,质谱条件为EI源,并采用全扫模式。

3.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,步骤(3)中ADAP对原始数据进行处理时,参数设置为:信噪比为5-8,最小峰高为100-2000,系数阈值为50-100,峰漂移时间范围为0-0.5分钟,保留时间漂移范围为0-0.5分钟。

4.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,步骤(4)中的光谱反褶积对色谱图进行比对和层次聚类采用RANSAC算法。

5.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,步骤(5)中生成.mgf文件和.csv文件中,.mgf文件包括所有的色谱和质谱数据,.csv文件作为元数据信息,包括峰面积、峰强度、保留时间和基峰信号。

6.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,步骤(6)中所述的MetGem软件形成分子网络,包括以下设置:EI-MS光谱通过选择整个光谱中±50Da的前6个峰进行过滤;使用m/z误差在0.3Th计算余弦值;创建的分子网络,设置边缘过滤条件为:余弦值大于0.7和超过六个匹配的峰。

7.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法,其特征在于,步骤(7)中所述的可视化软件为Cytoscape,进行分子网络图编辑具体包括:

为每个样本分配不同的颜色,以峰面积大小为含量,生成饼状图;设置edge余弦值为0.7。

8.根据权利要求1-7任一项所述的基于GC-MS建立分子网络的方法的应用,其特征在于,利用所述的方法建立分子结构特征组群,可用于不同来源、不同加工工艺的香原料或香精的真伪甄别,以及差异性比较。

9.根据权利要求1-7任一项所述的基于GC-MS建立分子网络的方法的应用,其特征在于,利用所述的方法建立分子结构特征组群,可用于香原料靶向组分的开发与鉴定。

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