[发明专利]一种植物根表微生物组的获取方法

说明书

本发明提供了一种植物根表微生物组的获取方法，属于微生物技术领域，所述获取方法包括以下步骤：将所述植物的根系浸没于表面活性剂中，进行超声波处理，收集含有植物根表微生物组的悬液。本发明采用表面活性剂弱化植物根表胞外膜蛋白或多糖层的粘附，从而降低微生物在根表的吸附能力。进一步通过超声波的震荡作用，可以使微生物从根表脱落，从而获得根表微生物悬液。本发明具有操作简便、针对性强、收集效率高等优点，有助于广泛应用于绝大多数种类土壤和(或)植物的根表活体微生物组的获取。

技术领域

本发明涉及微生物技术领域，尤其涉及一种植物根表微生物组的获取方法。

背景技术

植物根系提供了一个复杂的微生态环境，是大量微生物的互动栖息地。在植物根系直接影响的几毫米范围内生长繁殖的微生物被称为植物根系微生物，这些微生物显著影响着植物的生长发育和营养吸收等过程。根据不同的空间位置，植物根系又被分为根内、根表及根际三个生态位，它们之间的微生物群落结构具有显著差异。因此，充分利用和发挥根系不同生态位的微生物资源，开发生物肥料和生物防控剂，从而降低传统农业对化肥和农药的过度依赖，对于提高作物产量、保障农业的可持续发展等具有重要意义。

作为根内环境和土壤环境的中间屏障，根表在根内微生物定殖过程中起着重要的筛选作用。虽然国内外对植物根系微生物的研究取得了一定进展，但目前主要集中在根际和根内微生物组方面的研究，这是由于根表微生物含量通常较少且获取难度大。特别是，根表微生物通常表现为具有生物膜、细胞积聚性高，与植物根部表面结合密切，不易脱落等特点。因此，当前有关根表微生物提取方法的欠缺及有效性低是限制根表微生物研究的重要因素。

发明内容

本发明的目的在于提供一种植物根表微生物组的获取方法，本发明的获取方法具有针对性强、收集效率高等优点。

为了实现上述发明目的，本发明提供以下技术方案：

本发明提供了一种植物根表微生物组的获取方法，包括以下步骤：将所述植物的根系浸没于表面活性剂中，进行超声波处理，收集含有植物根表微生物组的悬液。

优选的，所述表面活性剂包括Tween 80。

优选的，所述Tween 80的浓度为0.3～0.8mmol/L。

优选的，所述超声波处理的温度为1～4℃；所述超声波处理的功率为50～120W；所述超声波处理的频率为40～60kHz。

优选的，所述超声波处理的次数为2～4次，每次超声波处理的时间独立为0.01～3min。

优选的，在所述收集含有植物根表微生物组的悬液后，还包括对所述悬液进行离心，收集沉淀，所述沉淀中含有植物根表微生物组。

优选的，所述离心的离心力为3000～5000g；所述离心的时间为5～10min。

优选的，在将所述植物的根系浸没于表面活性剂中前，还包括冲洗去除所述根系表面的土壤；所述冲洗采用的试剂包括磷酸盐缓冲液；所述磷酸盐缓冲液的pH值和所述根系的土壤的pH值一致。

优选的，所述冲洗的次数为2～3次。

优选的，所述植物包括烟草。

本发明提供了一种植物根表微生物组的获取方法，包括以下步骤：将所述植物的根系浸没于表面活性剂中，进行超声波处理，收集含有植物根表微生物组的悬液。本发明采用表面活性剂可有效弱化植物根表胞外膜蛋白或多糖层的粘附，从而降低微生物在根表的吸附能力。而且超声波的震荡作用，可以使微生物从根表脱落，从而获得含有根表微生物的悬液。本发明的方法获取的植物根表微生物组可直接用于微生物组DNA提取，也可将获得的根表微生物悬液直接平板涂布获得类群繁多的活体菌株，便于后续相关菌株的针对性研究。本发明具有操作简便、根表微生物特异性强、收集效率高等优点，有助于广泛应用于绝大多数种类土壤和(或)植物的根表活体微生物组的获取。