[发明专利]一种异构数据不依赖型蛋白质组学质谱分析系统及方法有效

专利信息
申请号: 202011005330.1 申请日: 2020-09-23
公开(公告)号: CN112185460B 公开(公告)日: 2022-07-08
发明(设计)人: 钟传奇;陈希;韩强强;尚骏;黄邵鑫;刘宜子;杜博贾;杨勇;周欣 申请(专利权)人: 谱度众合(武汉)生命科技有限公司
主分类号: G16B20/00 分类号: G16B20/00;G16B40/00;G16B50/30
代理公司: 武汉臻诚专利代理事务所(普通合伙) 42233 代理人: 胡星驰
地址: 430070 湖北省武汉市*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 一种 数据 不依赖 蛋白质 组学质 谱分析 系统 方法
【权利要求书】:

1.一种异构数据不依赖型蛋白质组学质谱分析系统,其特征在于,包括本地客户端和云端高性能服务器;

所述本地客户端,用于获取数据不依赖型原始数据和目标检测数据,并分别根据从云端高性能服务器调取数据解释器,将所述数据不依赖型原始数据解释为标准格式的数据不依赖型蛋白质组学质谱数据,将所述目标检测数据解释为标准格式的库文件,并根据所述标准格式的数据不依赖型蛋白质组学质谱数据和标准格式的库文件生成肽段谱图数据、伪肽段以及目标检测肽段,提交给高性能服务器端;

所述云端高性能服务器,用于根据所述本地客户端提供的肽段谱图数据、伪肽段、以及目标检测肽段进行数据分析,对数据分析结果进行保留时间正则化,以及回归计算,获得目标检测肽段的子离子系列强度以及假阳性率作为蛋白质组学分析结果,返回给所述本地客户端。

2.如权利要求1所述的异构数据不依赖型蛋白质组学质谱分析系统,其特征在于,所述本地客户端还用于从云端高性能服务器获得蛋白质组学分析结果并展示。

3.如权利要求1所述的异构数据不依赖型蛋白质组学质谱分析系统,其特征在于,所述本地客户端包括:数据解释器、谱图提取器和伪肽段生成器;

所述数据解释器,从高性能服务器调取,用于读取所述数据不依赖型原始数据和目标检测数据,并识别当前所支持类型的数据不依赖型原始数据和目标检测数据并分别转换为标准格式的数据不依赖型蛋白质组学质谱数据和标准格式的库文件,将所述标准格式的数据不依赖型蛋白质组学质谱数据和标准格式的库文件提交给谱图提取器,将所述标准格式的库文件提交给伪肽段生成器;

所述谱图提取器,用于根据标准格式的库文件对所述标准格式的数据不依赖型蛋白质组学质谱数据进行合并处理,获得肽段谱图数据,提交给云端高性能服务器;

所述伪肽段生成器,用于对所述标准格式的库文件进行生成运算,获得伪肽段,将伪肽段和目标检测肽段提交给云端高性能服务器。

4.如权利要求3所述的异构数据不依赖型蛋白质组学质谱分析系统,其特征在于,所述合并处理包括循环扫描、卷积合并、降噪;所述卷积合并为Tophat卷积运算或Bartlett卷积运算。

5.如权利要求3所述的异构数据不依赖型蛋白质组学质谱分析系统,其特征在于,所述生成运算是维持肽段成分不变且改变氨基酸顺序的运算。

6.如权利要求1所述的异构数据不依赖型蛋白质组学质谱分析系统,其特征在于,所述云端高性能服务器,包括数据分析器、正则器、和质量控制器;

所述数据分析器,用于根据肽段谱图数据、伪肽段、以及目标检测肽段数据,进行基于色谱、质谱、和/或离子淌度的打分,并根据打分结果预测目标检测肽段和伪肽段的信号值,提供给正则器;

所述正则器,用于根据目标检测肽段和伪肽段的信号值进行保留时间正则化、以及回归计算,获得目标检测肽段和伪肽段的子离子系列强度,提交给质量控制器;

所述质量控制器,用于根据目标检测肽段和伪肽段的子离子系列强度,计算肽段假阳性率,返回本地客户端。

7.一种异构数据不依赖型蛋白质组学质谱分析方法,其特征在于,应用如权利要求1至6任意一项所述的异构数据不依赖型蛋白质组学质谱分析系统。

8.如权利要求7所述的异构数据不依赖型蛋白质组学质谱分析方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)本地客户端读取本地异构数据不依赖型蛋白质组学质谱数据,调用云端高性能服务器,获取数据解释器;

(2)本地客户端在本地完成数据解释及谱图提取、伪肽段生成后,将肽段谱图数据、伪肽段以及目标检测肽段,提交给高性能服务器端;

(3)所述高性能服务器,根据所述本地客户端提供的肽段谱图数据、伪肽段、以及目标检测肽段进行数据分析,对数据分析结果进行保留时间正则化、以及回归计算,获得目标检测肽段的子离子系列强度以及假阳性率作为蛋白质组学分析结果,返回给所述本地客户端。

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