[发明专利]一种可溶于有机溶剂的DNA编码化合物及其中间体化合物有效

专利信息
申请号: 202010166002.3 申请日: 2020-03-11
公开(公告)号: CN111675744B 公开(公告)日: 2022-01-04
发明(设计)人: 李进;刘观赛;罗华东;谭平;万金桥 申请(专利权)人: 成都先导药物开发股份有限公司
主分类号: C07H21/00 分类号: C07H21/00;C40B40/08;C08G65/335
代理公司: 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 代理人: 李高峡;张娟
地址: 610000 四川省成都市双*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 可溶 有机溶剂 dna 编码 化合物 及其 中间体
【说明书】:

本发明提供了一种可溶于有机溶剂的DNA编码化合物及其中间体化合物,它具有式I所示的通式,其中,X为原子或分子骨架;A1为包含有连接基团和寡核苷酸的部分;A2为包含有连接基团和寡核苷酸的部分;M1为包含一个或多个结构单元的功能部分;M2为包含一个或多个可以增加在有机溶剂中溶解度的部分。本发明DNA编码化合物以支链形式引入聚乙二醇,既可以在前期化学反应增加DNA编码化合物在有机溶剂中的溶解度,又可以在后期进行生物筛选时将聚乙二醇断裂掉,提高DNA编码化合物在水中的溶解度,利于DNA编码化合物与生物靶标结合。本发明提高了DNA编码化合物及中间体在有机溶剂中的溶解度,扩展了可适用于DNA编码化合物库合成的反应类型。。

技术领域

本发明涉及一种可溶于有机溶剂的DNA编码化合物及其中间体化合物。

背景技术

在药物研发,尤其是新药研发中,针对生物靶标的高通量筛选是快速获得先导化合物的主要手段之一。然而,基于单个分子的传统高通量筛选所需时间长、设备投入巨大、库化合物数量有限(数百万),且化合物库的建成需要数十年的积累,限制了先导化合物的发现效率与可能性。近年来出现的DNA编码化合物库合成技术,结合了组合化学和分子生物学技术,在分子水平上将每个化合物加上一个DNA标签,能在极短的时间内合成高达亿级的化合物库。而且化合物能够通过基因测序的方法进行识别,大幅度地增加了化合物库的大小和合成效率,成为下一代化合物库筛选技术的趋势,并开始在国外制药行业广泛应用,产生了诸多积极的效果(Accounts of Chemical Research,2014,47,1247-1255)。

传统的DNA编码化合物库目前已应用于先导化合物的筛选,但是也存在一些局限:一般用于编码的DNA适用于水相反应,DNA编码化合物及中间体在纯有机溶剂中溶解度差,无法用于对水敏感的纯有机相化学反应,限制了可用于DNA编码化合物库的合成反应类型,降低了DNA编码化合物库中的分子多样性。

因此,需要开发一种新的DNA编码化合物库,提高DNA编码化合物及中间体在有机溶剂中的溶解度,扩展可适用于DNA编码化合物库合成的反应类型。专利CN107916456A公开了一种提高DNA编码化合物在有机条件下溶解度的方法,该方法是在小分子化合物和核酸之间插入聚乙二醇,这种方法能够大幅提高DNA编码化合物在有机条件下的溶解度。

但是,DNA编码化合物主要应用最终还是在水溶液中与生物靶标结合,进行后续生物筛选,如果DNA编码化合物在有机条件下的溶解度太大会导致其在水中溶解度太小或不溶,影响DNA编码化合物后续生物筛选。如果能够有一种DNA编码化合物在前期化学反应时在有机溶剂中的溶解度高,在后期生物筛选时在水中溶解度高,就能更加满足实际需求。而专利CN107916456A引入聚乙二醇在构建DNA编码化合物前,是作为化合物和核酸的连接,如果断裂会导致化合物和DNA编码断掉,因此在后续生物筛选中无法通过将聚乙二醇断裂提高DNA编码化合物在水中的溶解度。

研究一种DNA编码化合物在前期化学反应时在有机溶剂中的溶解度高,在后期生物筛选时在水中溶解度高,可以扩展DNA编码化合物的使用,对于DNA编码化合物的发展具有重要意义。

发明内容

为了解决上述问题,本发明提供了一种可溶于有机溶剂的DNA编码化合物及其中间体化合物。

本发明提供了一种DNA编码化合物或中间体化合物,它具有式I所示的通式:

其中,X为原子或分子骨架;

A1为包含有连接基团和寡核苷酸的部分;

A2为包含有连接基团和寡核苷酸的部分;

M1为包含一个或多个结构单元的功能部分;

M2为包含一个或多个可以增加在有机溶剂中溶解度的部分。

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