[发明专利]用于处理生物学相关数据的系统和方法、用于控制显微镜的系统和方法及显微镜在审

专利信息
申请号: 201980099046.4 申请日: 2019-06-07
公开(公告)号: CN114375448A 公开(公告)日: 2022-04-19
发明(设计)人: C·卡佩尔 申请(专利权)人: 徕卡显微系统CMS有限公司
主分类号: G06F16/33 分类号: G06F16/33;G02B21/36;G06F16/583;G06N3/02
代理公司: 北京思益华伦专利代理事务所(普通合伙) 11418 代理人: 赵飞;张素玲
地址: 德国韦*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 用于 处理 生物学 相关 数据 系统 方法 控制 显微镜
【权利要求书】:

1.一种系统(100、200、300),该系统包括一个或多个处理器(110)和一个或多个存储设备(120),其中,所述系统(100)配置为:

接收基于生物学相关语言的检索数据(101);

通过由所述一个或多个处理器(110)执行的经训练的语言识别机器学习算法(230),生成所述基于生物学相关语言的检索数据(101)的第一高维表示(260),其中,所述第一高维表示(260)包括至少3个条目,每个条目具有不同的值;

获得多个基于生物学相关图像的输入数据集或多个基于生物学相关语言的输入数据集的多个第二高维表示(105、250);并且

将所述第一高维表示(260)与所述多个第二高维表示(105、250)中的每个第二高维表示进行比较。

2.根据权利要求1所述的系统,其中,所述基于生物学相关语言的检索数据(101)是以下中的至少一种:核苷酸序列;蛋白质序列;对生物分子或生物结构的描述;对生物分子或生物结构的行为的描述;或对生物学功能或生物活性的描述。

3.根据前述权利要求中任一项所述的系统,其中,所述第一高维表示(260)的一个或多个条目的值与存在特定生物学功能或特定生物活性的可能性成比例。

4.根据前述权利要求中任一项所述的系统,其中,所述第二高维表示(105、250)的一个或多个条目的值与存在特定生物学功能或特定生物活性的可能性成比例。

5.根据前述权利要求中任一项所述的系统,该系统还包括显微镜(510),该显微镜(510)配置为通过拍摄生物样本的图像获得所述多个基于生物学相关图像的输入数据集。

6.根据前述权利要求中任一项所述的系统,其中,所述系统配置为基于所述比较来选择所述多个第二高维表示(105、250)中最接近所述第一高维表示(260)的第二高维表示。

7.根据权利要求6所述的系统,其中,所述系统配置为输出以下中的至少一个:最接近的第二高维表示;所述多个基于生物学相关图像的输入数据集中对应于最接近的第二高维表示的基于生物学相关图像的输入数据集;或所述多个基于生物学相关语言的输入数据集中对应于最接近的第二高维表示的基于生物学相关语言的输入数据集。

8.根据前述权利要求中任一项所述的系统,其中,所述第一高维表示(260)与所述多个第二高维表示(105、250)中的每个第二高维表示的比较基于欧几里德距离函数或推土机距离函数来进行。

9.根据前述权利要求中任一项所述的系统,其中,所述第一高维表示(260)和所述第二高维表示(105、250)为数字表示。

10.根据前述权利要求中任一项所述的系统,其中,所述第一高维表示(260)和所述第二高维表示(105、250)均包括100个以上的维度。

11.根据前述权利要求中任一项所述的系统,其中,所述第一高维表示(260)是第一向量并且所述第二高维表示(105、250)是第二向量。

12.根据前述权利要求中任一项所述的系统,其中,所述第一高维表示(260)的所述条目的50%以上的值和所述第二高维表示(105、250)的所述条目的50%以上的值不等于0。

13.根据前述权利要求中任一项所述的系统,其中,所述第一高维表示(260)的5个以上的条目的值比所述第一高维表示(260)的所述条目的最大绝对值大10%,并且所述多个第二高维表示(105、250)中的每个第二高维表示的5个以上的条目的值比所述第二高维表示(105、250)的所述条目的相应最大绝对值大10%。

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