[发明专利]工程化长散在元件(LINE)转座子及其使用方法在审
申请号: | 201980069027.7 | 申请日: | 2019-10-21 |
公开(公告)号: | CN112912497A | 公开(公告)日: | 2021-06-04 |
发明(设计)人: | 肖恩·克里斯滕森 | 申请(专利权)人: | 德克萨斯州大学系统董事会 |
主分类号: | C12N9/22 | 分类号: | C12N9/22;C12N15/90 |
代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司 11021 | 代理人: | 柴云峰;张莹 |
地址: | 美国德*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 工程 化长散 元件 line 座子 及其 使用方法 | ||
1.RNA成分,其包含DNA靶向序列,一个或多个蛋白质结合基序(PBM)以及待整合到DNA靶位点中的目标核酸序列,其中所述DNA靶向序列,蛋白质结合基序和目标序列可操作地连接,使得它们能够与源自亲本长散在(LINE)元件蛋白质的蛋白质成分结合并逆转录成cDNA,所述cDNA能够在DNA靶位点整合到DNA中。
2.根据权利要求1所述的RNA成分,其中所述蛋白质成分包含RNA结合结构域、接头结构域、逆转录酶、DNA内切核酸酶中的一个或多个,其中所述一个或多个蛋白质结合基序将所述RNA成分结合至所述蛋白质成分的所述RNA结合结构域、接头结构域、逆转录酶、DNA内切核酸酶或其组合。
3.根据权利要求1或2所述的RNA成分,
其中所述RNA成分包含来自或衍生自亲本LINE或SINE骨架的元件,并且所述RNA成分的目标核酸序列与LINE或SINE异源;
其中所述蛋白质成分包含来自或衍生自亲本LINE的元件;或
其组合。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的RNA成分,其中所述DNA靶向序列与所述亲本LINE或SINE是异源的。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的RNA成分,其中所述目标序列编码基因、基因的片段或功能性核酸。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的RNA成分,其包含来自或衍生自亲本LINE或SINE元件的3'PBM序列。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的RNA成分,其包含CRISPR/Cas示踪序列、CRISPR/Cas引导序列或其组合。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的RNA成分,其包含来自或衍生自亲本LINE或SINE元件的5'PBM序列。
9.根据权利要求8所述的RNA成分,其中所述5′PBM包含非功能性IRES序列。
10.根据权利要求1-9中任一项所述的RNA成分,其进一步包含核酶。
11.根据权利要求10所述的RNA成分,其中所述核酶是丁型肝炎病毒样核酶。
12.根据权利要求2-10中任一项所述的RNA成分,其中所述亲本LINE或SINE是限制样内切核酸酶(RLE)LINE。
13.根据权利要求10所述的RNA成分,其中RLE LINE是R2 LINE。
14.根据权利要求3-13中任一项所述的RNA成分,其中所述RNA成分的亲本LINE或SINE骨架与所述蛋白成分的亲本LINE骨架是相同的LINE和/或所述SINE源自LINE的祖先或是LINE的祖先。
15.蛋白质成分,其包含DNA结合结构域、RNA结合结构域、逆转录酶、接头结构域和内切核酸酶,其中所述DNA结合结构域、RNA结合结构域、逆转录酶、接头结构域和内切核酸酶可操作地连接,使得它们可以在DNA靶位点与RNA成分和DNA结合,并促进RNA成分逆转录成cDNA,和cDNA在DNA靶位点整合到DNA中。
16.根据权利要求15所述的蛋白质成分,其中所述RNA成分包含DNA靶向序列,一个或多个蛋白质结合基序以及待整合到所述DNA靶位点的目标核酸序列。
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