[发明专利]用于检测NTRK融合蛋白的组织化学和细胞化学方法在审
| 申请号: | 201980060054.8 | 申请日: | 2019-09-13 |
| 公开(公告)号: | CN112673258A | 公开(公告)日: | 2021-04-16 |
| 发明(设计)人: | J·冯;F·汉森;L·基维;P·努佐;J·帕廷;J·佩特 | 申请(专利权)人: | 文塔纳医疗系统公司 |
| 主分类号: | G01N33/574 | 分类号: | G01N33/574;G01N33/566;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京坤瑞律师事务所 11494 | 代理人: | 岑晓东 |
| 地址: | 美国亚*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 检测 ntrk 融合 蛋白 组织化学 细胞 化学 方法 | ||
1.一种检测非神经内分泌肿瘤样品中的TrkA、TrkB或TrkC融合蛋白的方法,所述方法包括:
用生物标志物特异性试剂对所述样品进行亲和组织化学染色,所述生物标志物特异性试剂与以下项中的一项或多项特异性地结合:包含SEQ ID NO:1的残基363-760、基本上由其组成或由其组成的氨基酸序列;包含SEQ ID NO:2的残基646-838、基本上由其组成或由其组成的氨基酸序列;或者包含SEQ ID NO:3的残基718-839、基本上由其组成或由其组成的氨基酸序列;
检测所述样品中的染色模式;以及
如果所述样品具有其中大于或等于阈值百分比的肿瘤细胞染色高于阈值特异性染色强度的染色模式,则评定所述样品对涉及TrkA、TrkB或TrkC的融合蛋白呈阳性。
2.根据权利要求1所述的方法,其中染色高于所述阈值特异性染色强度的肿瘤细胞的所述百分比为整个肿瘤区域中肿瘤细胞的百分比。
3.根据权利要求1和2中任一项所述的方法,其中肿瘤细胞的所述阈值百分比在50%至75%的范围内,并且所述阈值染色强度为至少1.5。
4.根据权利要求3所述的方法,其中肿瘤细胞的所述阈值百分比为50%,并且所述阈值染色强度为1.75。
5.根据权利要求3所述的方法,其中肿瘤细胞的所述阈值百分比为60%,并且所述阈值染色强度为1.75。
6.根据权利要求3所述的方法,其中肿瘤细胞的所述阈值百分比为75%,并且所述阈值染色强度为1.75。
7.根据权利要求3所述的方法,其中肿瘤细胞的所述阈值百分比为50%,并且所述阈值染色强度为2。
8.根据权利要求3所述的方法,其中肿瘤细胞的所述阈值百分比为60%,并且所述阈值染色强度为2。
9.根据权利要求3所述的方法,其中肿瘤细胞的所述阈值百分比为75%,并且所述阈值染色强度为2。
10.根据权利要求3所述的方法,其中肿瘤细胞的所述阈值百分比为50%,并且所述阈值染色强度为3。
11.根据权利要求3所述的方法,其中肿瘤细胞的所述阈值百分比为60%,并且所述阈值染色强度为3。
12.根据权利要求3所述的方法,其中肿瘤细胞的所述阈值百分比为75%,并且所述阈值染色强度为3。
13.根据权利要求2至12中任一项所述的方法,其中所述样品具有膜染色模式和/或细胞质染色模式。
14.根据权利要求1至13中任一项所述的方法,其中染色高于所述阈值特异性染色强度的肿瘤细胞的百分比为在具有阈值水平的邻接肿瘤细胞的肿瘤细胞区域内的肿瘤细胞的百分比。
15.根据权利要求14所述的方法,其中邻接肿瘤细胞的所述阈值水平为至少20个邻接细胞,细胞的所述阈值百分比在20%至90%的范围内,并且所述阈值染色强度为高于背景的任何特异性染色。
16.根据权利要求14所述的方法,其中邻接肿瘤细胞的所述阈值水平为至少20个邻接细胞,细胞的所述阈值百分比在20%至90%的范围内,并且所述阈值染色强度为0.5。
17.根据权利要求14所述的方法,其中邻接肿瘤细胞的所述阈值水平为至少50个邻接细胞且细胞的所述阈值百分比为至少80%,并且所述阈值染色强度为高于背景的任何特异性染色。
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