[发明专利]复杂样本中相关化合物的识别和评分

说明书

从样本混合物中分离并分析已知化合物和已知化合物的至少一种加合物、修改形式或肽。针对已知化合物的M种产物离子和该至少一种加合物、修改形式或肽的L种产物离子中的每种产物离子计算XIC。使用曲线减法根据M个XIC计算第一XIC峰组，并且根据L个XIC计算第二XIC峰组。为两个XIC峰组选择代表性的第一XIC峰和第二XIC峰。将第二XIC峰的保留移位从数据库中找到的预期保留时间差异。如果第一XIC峰与第二XIC峰的保留时间的差异在阈值内，那么将第一XIC峰的保留时间核实为已知化合物的保留时间。

相关申请

本申请要求于2018年8月31日提交的美国临时专利申请序列No.62/725,989的权益，其内容通过引用整体并入本文。

技术领域

本文的教导涉及在化合物的识别或量化中包括该化合物的加合物、修改形式或肽。更具体而言，本文的教导涉及用于使用关于已知化合物的一种或多种加合物、修改形式或肽的信息来识别或核实已知化合物的保留时间的系统和方法。本文公开的系统和方法是使用耦合到分离设备的质谱仪来执行的，该分离设备诸如但不限于液相色谱(LC)设备。本文公开的系统和方法还结合处理器、控制器、微控制器或计算机系统(诸如图1的计算机系统)来执行。

背景技术

保留时间模糊(retention time ambiguity)

质谱仪常常与色谱法或其它分离系统耦合，以识别和表征从样本中洗脱的已知的感兴趣的化合物。在这种耦合系统中，洗脱溶剂被离子化，并以指定的时间间隔从洗脱溶剂中获得一系列质谱。这些时间间隔的范围例如从1秒到100分钟或更大。这一系列质谱形成色谱图或提取离子色谱图(XIC)。

在XIC中找到的峰被用于识别或表征样本中的已知化合物。但是，在复杂的混合物中，与具有相同质荷比(m/z)的其它峰的干扰会使得难以确定表示已知化合物的峰。在一些情况下，没有关于已知化合物的预期保留时间的信息可用。在其它情况下，已知化合物的大概保留时间可以是已知的。但是，即使在这后一种情况下，如果样本复杂或者如果样本之间的保留时间变化不止是少量的，那么已知化合物的确切峰也可以是不明确的。因此，在这些情况下常常难以识别或表征已知化合物。

在传统的分离耦合质谱系统中，选择已知化合物的碎片或产物离子以进行分析。然后，在分离的每个间隔针对包括产物离子的质量范围执行质谱/质谱(MS/MS)扫描。随时间收集每次MS/MS扫描中找到的产物离子的强度，并将其作为例如XIC或谱的集合进行分析。

例如，对于简单的样本混合物，通常在XIC中在已知化合物的预期保留时间处找到表示产物离子的单个峰。但是，对于更复杂的混合物，除了已知化合物的预期保留时间外，在谱的集合中，表示产物离子的两个或更多个峰还位于一个或多个附加时间间隔处。换句话说，产物离子的XIC可以有两个或更多个峰。

识别更复杂混合物中的感兴趣的化合物的一种传统方法是对其中已知化合物的产物离子中的两种或更多种产物离子具有峰的时间间隔进行定位。例如，当量化已知序列的肽时，这种方法可以被用在蛋白质组学中。

在典型的多反应监视(MRM)方法中，监视两个或更多个MRM转变，每个转变与肽的不同产物离子转变对应。如果先前的发现数据可用，那么这些转变基于数据中观察到的最大产物离子。否则，这些转变基于例如预测的y离子。针对这两个或更多个MRM转变分析XIC。对所有转变存在产物离子峰的时间被用来表征已知化合物。

对于复杂的样本，尤其是如果不能准确地知道预期保留时间，那么产物离子谱的集合中会存在模糊。例如，可以有多于一个对于两个或更多个MRM转变中的每个转变存在产物离子峰的保留时间或时间间隔。