[发明专利]复杂样本中相关化合物的识别和评分

权利要求书

1.一种用于使用已知化合物的加合物、修改形式或肽来核实所述已知化合物的保留时间的系统，包括：

分离设备，所述分离设备从样本混合物中分离已知化合物和所述已知化合物的至少一种加合物、修改形式或肽；

质谱仪，所述质谱仪在多个保留时间中的每个保留时间处使用一个或多个顺序的质量窗口宽度以便跨越整个质量范围来对分离的样本混合物执行一次或多次质谱/质谱MS/MS扫描，从而产生针对所述多个保留时间的整个质量范围的产物离子谱的集合；

数据库，所述数据库包括所述已知化合物和所述已知化合物的所述至少一种加合物、修改形式或肽的产物离子的预期保留时间和预期产物离子质谱；以及

处理器，所述处理器：

接收针对所述多个保留时间的整个质量范围的产物离子谱的集合，

使用数据库选择所述已知化合物的M种产物离子，

根据产物离子谱的集合针对所述M种产物离子中的每种产物离子计算XIC，从而产生M个XIC，

使用曲线减法根据所述M个XIC计算表示所述已知化合物的第一XIC峰组，

选择表示所述已知化合物的第一XIC峰组的第一XIC峰；

使用数据库选择所述已知化合物的所述至少一种加合物、修改形式或肽的L种产物离子，

根据产物离子谱的集合针对所述L种产物离子中的每种产物离子计算XIC，从而产生L个XIC，

使用曲线减法根据所述L个XIC计算表示所述已知化合物的所述至少一种加合物、修改形式或肽的第二XIC峰组，

选择表示所述已知化合物的所述至少一种加合物、修改形式或肽的第二XIC峰组的第二XIC峰，

将第二XIC峰的保留移位从数据库中找到的第一XIC峰的预期保留时间与从数据库中找到的第二XIC峰的预期保留时间之间的差异，以及

如果第二XIC峰的移位的保留时间在第一XIC峰的保留时间的保留时间阈值内，那么核实第一XIC峰的保留时间是所述已知化合物的保留时间。

2.如权利要求1所述的系统，其中处理器还比较第一XIC峰与第二XIC峰的相似性，并且基于相似性对第一XIC峰和第二XIC峰进行评分。

3.如权利要求1所述的系统，其中处理器通过以下操作来使用曲线减法根据所述M个XIC计算表示所述已知化合物的第一XIC峰组：

从其它M个XIC中的每个XIC减去所述M个XIC中的每个XIC，从而产生条减法曲线，其中每条减法曲线是根据第一XIC和第二XIC通过以下来计算的：在每个保留时间，将第一XIC在该每个保留时间处的强度与第一XIC在两个或更多个相邻保留时间处的两个或更多个强度归一化，将第二XIC在该每个保留时间处的强度与第二XIC在相邻保留时间处的两个或更多个强度归一化，从第一XIC的对应的归一化的强度中减去第二XIC的归一化的强度，以及计算差异强度的统计度量，

识别其中所述条减法曲线中的一条或多条减法曲线具有在零的阈值内的值的一个或多个保留时间的至少一个区域，以及

对于所述至少一个区域，获得用于计算识别所述区域的所述一条或多条减法曲线的两个或更多个XIC，并将所述两个或更多个XIC中的在所述区域中的每个峰添加到第一峰组。

4.如权利要求3所述的系统，其中计算差异强度的统计度量包括计算差异强度的平均值。

5.如权利要求4所述的系统，其中针对保留时间i+m计算的差异强度的平均值μ_i+m是根据下式计算的：

其中N是在每个保留时间处计算的差异强度的数量，N是奇数，m是N的中点，并且对于j＝1到N的是针对保留时间i+m计算的差异强度。

6.如权利要求3所述的系统，其中计算差异强度的统计度量包括计算差异强度的标准偏差。