[发明专利]类芽孢杆菌属的突变体及其使用方法

权利要求书

1.一种组合物，其包含类芽孢杆菌属种(Paenibacillus sp.)菌株的生物学纯的培养物，所述菌株包含缺少功能性受体结构域或功能性DNA结合结构域的突变型DegU和/或缺少功能性单结合结构域或功能性ATP酶结构域的突变型DegS，

其中与包含野生型DegU和野生型DegS的类芽孢杆菌属种菌株的液体培养物相比，突变型DegU和/或突变型DegS导致具有降低的粘度的类芽孢杆菌属种菌株的液体培养物。

2.根据权利要求1的组合物，其中所述突变型DegU和/或突变型DegS抑制具有粘液样形态的类芽孢杆菌属种菌株的菌落的形成。

3.根据权利要求1或权利要求2的组合物，其中突变型DegU和/或突变型DegS是敲除的或由于提前终止密码子而截短的。

4.根据权利要求3所述的组合物，其中所述提前终止密码子导致在第218位处截短的突变型DegU，所述第218位是相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列编号的。

5.根据前述权利要求中任一项的组合物，其中所述突变型DegU包含以下氨基酸置换：

第109位处小残基到酸性残基的氨基酸置换，所述第109位是相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列编号的；和/或

第228位处小残基到极性残基的氨基酸置换，所述第228位是相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列编号的；和/或

第63位处酸性残基到极性残基的氨基酸置换，所述第63位是相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列编号的；和/或

第195位处极性残基到小残基的氨基酸置换，所述第195位是相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列编号的；和/或

第204位处疏水性残基到小残基的氨基酸置换，所述第204位是相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列编号的；和/或

第208位处极性残基到小残基的氨基酸置换，所述第208位是相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列编号的；和/或

第212位处碱性残基到小残基的氨基酸置换，所述第212位是相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列编号的；和/或

第217位处疏水性残基到小残基的氨基酸置换，所述第217位是相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列编号的；和/或

第207位处碱性残基到小残基的氨基酸置换，所述第207位是相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列编号的；和/或

第211位处极性残基到小残基的氨基酸置换，所述第211位是相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列编号的；和/或

第214位处极性残基到小残基的氨基酸置换，所述第214位是相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列编号的。

6.根据前述权利要求中任一项的组合物，其中所述突变型DegU包含具有G109D和/或A228T和/或D63N和/或N195A和/或I204A和/或T208A和/或H212A和/或L217A和/或K207A和/或N211A和/或S214A的氨基酸置换的SEQ ID NO:2；或

其具有保守性氨基酸置换的变体。

7.根据前述权利要求中任一项的组合物，其中所述突变型DegS包含以下氨基酸置换：

第99位处疏水性残基到芳香族残基的氨基酸置换，所述第99位是相对于SEQ ID NO:4的氨基酸序列编号的；和/或

第294位处酸性残基到碱性残基的氨基酸置换，所述第294位是相对于SEQ ID NO:4的氨基酸序列编号的；和/或

第73位处极性残基到小残基的氨基酸置换，所述第73位是相对于SEQ ID NO:4的氨基酸序列编号的；和/或

第190位处小残基到疏水性残基的氨基酸置换，所述第190位是相对于SEQ ID NO:4的氨基酸序列编号的。

8.根据前述权利要求中任一项的组合物，其中所述突变型DegS包含具有L99F和/或E294K和/或T73A和/或A190V的氨基酸置换的SEQ ID NO:4；或

其具有保守性氨基酸置换的变体。