[发明专利]生物信息的分析方法、装置和存储介质在审
申请号: | 201911318537.1 | 申请日: | 2019-12-19 |
公开(公告)号: | CN110750362A | 公开(公告)日: | 2020-02-04 |
发明(设计)人: | 王今安;贺增泉;湛瑜;陈梦思;罗劲星 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因科技服务有限公司 |
主分类号: | G06F9/50 | 分类号: | G06F9/50;G16B50/30 |
代理公司: | 11227 北京集佳知识产权代理有限公司 | 代理人: | 李慧引 |
地址: | 518083 广东省深圳市盐田区*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分析流程 运算 计算设备 资源需求 连接关系 样本信息 分布式系统 并行处理 存储介质 分层结构 计算资源 生物信息 分析 和运算 调用 分配 配置 申请 | ||
1.一种生物信息的分析方法,其特征在于,包括:
根据待分析样本信息生成分析流程;其中,所述分析流程包括多个节点、以及节点和节点之间的连接关系,每一个所述节点均包括多个运算任务,每个所述运算任务均配置有对应的资源需求;
依据所述节点和节点之间的连接关系,逐个将所述分析流程中的节点提供于分布式系统,使所述分布式系统的多个计算设备处理所述节点的运算任务,得到所述运算任务的处理结果;其中,所述计算设备处理的运算任务的资源需求与所述计算设备的可用计算资源匹配,节点的每一个运算任务的处理结果,组合为所述节点的执行结果,所述待分析样本信息的分析结果至少包括所述分析流程的结束节点的执行结果。
2.根据权利要求1所述的分析方法,其特征在于,所述将分析流程中的节点提供于分布式系统,包括:
针对所述节点的每一个运算任务,判断所述分布式系统中是否存在可用计算资源满足所述运算任务的资源需求的计算设备;
针对所述节点的每一个运算任务,若判断出所述分布式系统中存在可用计算资源满足所述运算任务的资源需求的计算设备,将所述运算任务发送至所述计算设备,使所述计算设备处理所述运算任务,得到所述运算任务的处理结果。
3.根据权利要求2所述的分析方法,其特征在于,所述针对所述节点的每一个运算任务,判断当前所述分布式系统中是否存在可用计算资源满足所述运算任务的资源需求的计算设备之后,还包括:
针对所述节点的每一个运算任务,若所述分布式系统中不存在可用计算资源满足所述运算任务的资源需求的计算设备,将所述运算任务保存在任务队列中;
针对所述任务队列的每一个运算任务,按一定时间间隔判断所述分布式系统中是否存在可用计算资源满足运算任务的资源需求的计算设备;
针对所述任务队列的每一个运算任务,若判断出所述分布式系统中存在可用计算资源满足所述运算任务的资源需求的计算设备,将所述运算任务发送至所述计算设备,使所述计算设备处理所述运算任务,得到处理结果。
4.根据权利要求1至3任意一项所述的分析方法,其特征在于,所述运算任务的资源需求,包括处理所述运算任务所需的线程数,以及处理所述运算任务所需的内存空间;
可用计算资源满足所述运算任务的资源需求的计算设备,指代,可用线程的数量大于或等于处理所述运算任务所需的线程数,并且,可用内存空间大于处理所述运算任务所需的内存空间的计算设备。
5.一种生物信息的分析装置,其特征在于,包括:
生成单元,用于根据待分析样本信息生成分析流程;其中,所述分析流程包括多个节点、以及节点和节点之间的连接关系,每一个所述节点均包括多个运算任务,每个所述运算任务均配置有对应的资源需求;
执行单元,用于依据所述节点和节点之间的连接关系,逐个将所述分析流程中的节点提供于分布式系统,使所述分布式系统的多个计算设备处理所述节点的运算任务,得到所述运算任务的处理结果;其中,所述计算设备处理的运算任务的资源需求与所述计算设备的可用计算资源匹配,节点的每一个运算任务的处理结果,组合为所述节点的执行结果,所述待分析样本信息的分析结果至少包括所述分析流程的结束节点的执行结果。
6.根据权利要求5所述的分析装置,其特征在于,所述执行单元将分析流程中的节点提供于分布式系统时,具体用于:
针对所述节点的每一个运算任务,判断所述分布式系统中是否存在可用计算资源满足所述运算任务的资源需求的计算设备;
针对所述节点的每一个运算任务,若判断出所述分布式系统中存在可用计算资源满足所述运算任务的资源需求的计算设备,将所述运算任务发送至所述计算设备,使所述计算设备处理所述运算任务,得到所述运算任务的处理结果。
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