[发明专利]用于探索化合物的设备和方法

权利要求书

1.一种用于探索化合物的设备，包括：

定义单元，其被配置成定义晶格空间，所述晶格空间是多个化合物基团被顺序地排列的晶格的集合；

限制单元，其被配置成在所述化合物基团中的任一个排列在所述晶格空间的任何晶格中，然后在所述晶格空间中排列下一化合物基团的情况下，生成受限晶格空间，所述受限晶格空间是通过从所述晶格空间中消除用于要排列的所述下一化合物基团的不希望的区域而创建的空间；

分配单元，其被配置成向所述受限晶格空间中的可以排列所述化合物基团的晶格点中的每一个分配位；以及

算术单元，其被配置成根据模拟退火对基于与所述晶格点中的每一个有关的限制条件通过转换获得的伊辛模型执行基态探索，从而计算所述伊辛模型的最小能量，

其中，所述设备是用于探索多个所述化合物基团彼此链接的所述化合物的设备。

2.根据权利要求1所述的设备，

其中，所述受限晶格空间的生成是通过设定排列成直链的所述化合物基团的最大数量而执行的。

3.根据权利要求1所述的设备，

其中，所述受限晶格空间的生成是通过设定排列成直链的所述化合物基团的最大数量并排除通过设定所述最大数量而生成的晶格空间中存在的过量晶格而执行的。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的设备，

其中，所述化合物基团是氨基酸残基。

5.根据权利要求4所述的设备，

其中，所述化合物是蛋白质。

6.一种用于探索化合物的方法，所述方法包括：

定义晶格空间，所述晶格空间是多个化合物基团被顺序地排列的晶格的集合；

在所述化合物基团中的任一个排列在所述晶格空间的任何晶格中，然后在所述晶格空间中排列下一化合物基团的情况下，生成受限晶格空间，所述受限晶格空间是通过从所述晶格空间中消除用于要排列的所述下一化合物基团的不希望的区域而创建的空间；

向所述受限晶格空间中的可以排列所述化合物基团的晶格点中的每一个分配位；以及

根据模拟退火对基于与所述晶格点中的每一个有关的限制条件通过转换获得的伊辛模型执行基态探索，从而计算所述伊辛模型的最小能量，

其中，所述方法是用于使得计算机能够探索多个所述化合物基团彼此链接的所述化合物的方法。

7.根据权利要求6所述的方法，

其中，通过设定排列成直链的化合物基团的最大数量来执行生成所述受限晶格空间。

8.根据权利要求6所述的方法，

其中，通过设定排列成直链的化合物基团的最大数量并排除通过设定所述最大数量而生成的晶格空间中存在的过量晶格来执行生成所述受限晶格空间。

9.根据权利要求6至8中任一项所述的方法，

其中，所述化合物基团是氨基酸残基。

10.根据权利要求9所述的方法，

其中，所述化合物是蛋白质。