[发明专利]一种水稻种子耐贮藏性基因sd1及其分子标记和应用

权利要求书

1.一种水稻种子耐贮藏基因sd1，其特征在于，其为以下任一：

(1)所述sd1的全长序列如SEQ ID No.2所示；或

(2)所述sd1的全长序列为SEQ ID NO.4所示序列的第139位插入一个T；或

(3)所述sd1的全长序列为SEQ ID NO.4所示序列的第134-137位的4个碱基缺失；或

(4)所述sd1的全长序列为SEQ ID NO.4所示序列的第127-144位的18个碱基缺失。

2.权利要求1所述的水稻种子耐贮藏基因sd1编码的蛋白，其特征在于，其氨基酸序列如SEQ ID No.3所示。

3.含有权利要求1所述的水稻种子耐贮藏基因sd1的生物材料，所述生物材料为载体、转基因细胞系、工程菌、宿主细胞或表达盒。

4.权利要求1所述的水稻种子耐贮藏基因sd1、权利要求2所述的蛋白或权利要求3所述的生物材料的以下任一种应用：

(1)在培育耐贮藏性水稻新品种中的应用；

(2)在调控水稻种子耐贮藏性状、提高水稻种子耐贮藏性、或提供水稻种子抗氧化胁迫能力中的应用。

5.水稻SD1基因在负调控水稻种子耐贮藏性中的应用，所述水稻SD1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。

6.水稻SD1基因在负调控水稻种子抗氧化胁迫中的应用，所述水稻SD1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。

7.水稻耐贮藏基因sd1的分子标记，其特征在于，相比于野生型基因SD1，其所示的核苷酸序列的第二个内含子中存在一段25bp的缺失，即SEQ ID NO.4所示的野生型SD1基因的第1262-第1286的共25bp的片段缺失。

8.根据权利要求7所述的分子标记，其特征在于，可通过核苷酸序列如SEQ ID NO.6-7所示的引物对PCR扩增得到。

9.权利要求7或8所述的分子标记的以下任一应用，

(1)在培育耐贮藏性水稻新品种、或抗氧化胁迫能力强的水稻新品种中的应用；

(2)在水稻种子耐贮藏改良育种中的应用；

(3)筛选耐贮藏能力强的水稻种子、或抗氧化胁迫能力强的水稻种子，或淘汰耐贮藏能力弱、或抗氧化胁迫能力弱的水稻种子中的应用；

(4)在检测权利要求7或8所述分子标记基因型中的应用。

10.根据权利要求9所述的应用，其特征在于，通过核苷酸序列如SEQ ID NO.6-7所示的引物对样品基因组DNA进行PCR扩增，PCR扩增产物在全自动毛细管电泳仪中检测，若电泳结果出现一条大小为468bp的特征条带，则待测水稻含有野生型SD1，水稻种子耐贮藏性低；若电泳结果出现一条大小为443bp的特征条带，则待测水稻含有突变型sd1种子耐贮藏性高；若电泳结果出现上述两条特征条带，则待测水稻为杂合型。