[发明专利]一种优化用于检测蛋白的传感器阵列的方法及传感器阵列有效
| 申请号: | 201910444076.6 | 申请日: | 2019-05-27 |
| 公开(公告)号: | CN110244055B | 公开(公告)日: | 2022-07-22 |
| 发明(设计)人: | 谭春燕;沈祎舜;谭英 | 申请(专利权)人: | 清华大学深圳研究生院 |
| 主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68;G01N21/64 |
| 代理公司: | 北京思创大成知识产权代理有限公司 11614 | 代理人: | 高爽 |
| 地址: | 518055 广东省深圳市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 优化 用于 检测 蛋白 传感器 阵列 方法 | ||
1.一种优化用于检测蛋白的传感器阵列的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:
S1.确定至少一个目标蛋白;
S2.建立传感器阵列,所述传感器阵列包括多个传感单元,每一传感单元对应一个荧光化合物,所述荧光化合物对于目标蛋白具有荧光响应;
S3.配制单一目标蛋白的溶液A1-An,以及,配制全部目标蛋白的混合溶液B1-Bn,每个所述混合溶液中各有一种目标蛋白的浓度不低于其他目标蛋白,除该浓度相对高的目标蛋白外,各组混合溶液中其他目标蛋白的浓度相同,并且,所述混合溶液B1-Bn中浓度相对高的目标蛋白各不相同;
S4.将所述传感器阵列分别与所述溶液A1-An混合,并进行荧光扫描,得到荧光数据DA1-DAn,然后计算各传感单元的贡献度;
计算各传感单元的贡献度的步骤包括:
1)计算组内方差Sw,计算公式为
2)计算组间方差Sb,计算公式为
3)计算贡献度Sw/Sb;
其中n表示蛋白的种类;m表示实验重复的组数;表示这个荧光分子区分第i个蛋白时的特征值的平均值矩阵;表示这个荧光分子区分所有蛋白时的特征值的平均值矩阵;Mi,j表示这个荧光分子区分第i个蛋白时的第j个重复实验矩阵;
S5.按贡献度由大到小的顺序,将各传感单元依次并入,形成传感器阵列SA1-SAn,将所述传感器阵列SA1-SAn分别与所述溶液A1-An以及所述混合溶液B1-Bn混合,进行荧光扫描,得到针对每一传感器阵列的单一蛋白荧光数据DiA1-DiAn以及混合蛋白荧光数据DiB1-DiBn,其中,i代表第i个传感器阵列;
S6.用PCA算法和LDA算法处理所述荧光数据DiA1-DiAn以及荧光数据DiB1-DiBn,分别得到荧光数据DiA1-DiAn以及荧光数据DiB1-DiBn的PCA图谱和LDA图谱;
S7.根据图谱中数据点的离散程度,确定传感器阵列SA1-SAn中最优的传感器阵列。
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