[发明专利]系统性硬化症诊断的脂肪酸代谢物分析检测方法在审
申请号: | 201910429110.2 | 申请日: | 2019-05-22 |
公开(公告)号: | CN110221011A | 公开(公告)日: | 2019-09-10 |
发明(设计)人: | 王丹丹;孙凌云;冯学兵;张华勇;孙宸 | 申请(专利权)人: | 南京鼓楼医院 |
主分类号: | G01N30/88 | 分类号: | G01N30/88;G01N30/86 |
代理公司: | 南京钟山专利代理有限公司 32252 | 代理人: | 蒋厦 |
地址: | 210008 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 系统性硬化症 脂肪酸代谢 超高效液相色谱 分析检测 诊断 氨水 样品预处理 检测分析 连续分析 评价系统 色谱条件 实验数据 梯度洗脱 样本队列 质谱分析 灵敏度 进样量 流动相 乙酸铵 质谱仪 分辨率 乙腈 质控 柱温 样本 监测 分析 | ||
1.一种系统性硬化症诊断的脂肪酸代谢物分析检测方法,其特征在于:样品预处理后,采用超高效液相色谱UHPLC进行分离,色谱条件为:柱温25℃;流速0.3mL/min;进样量2μL;流动相组成A:水+25mM乙酸铵+25mM氨水,B:乙腈;梯度洗脱程序如下:0-1min,95%B;1-14min,B从95%线性变化至65%;14-16min,B从65%线性变化至40%;16-18min,B维持在40%;18-18.1min,B从40%线性变化至95%;18.1-23min,B维持在95%;自动进样器4℃;为避免仪器检测信号波动而造成的影响,采用随机顺序进行样本的连续分析,样本队列中插入质控QC样品,用于监测和评价系统的稳定性及实验数据的可靠性;样品经超高效液相色谱UHPLC分离后用质谱仪Q-TOF进行质谱分析,Q-TOF质谱条件为:分别采用电喷雾电离ESI正离子和负离子模式进行检测。
2.根据权利要求1所述的系统性硬化症诊断的脂肪酸代谢物分析检测方法,其特征在于:样品预处理步骤为:-80℃取样本,在4℃环境下缓慢解冻后,分别取各组样本100ul后加入400ul预冷甲醇/乙腈溶液涡旋混合,其中甲醇:乙腈=1:1(v/v),-20℃静置60min,14000g4℃离心20min,取上清真空干燥。
3.根据权利要求1所述的系统性硬化症诊断的脂肪酸代谢物分析检测方法,其特征在于:所述的色谱柱为Agilent 1290 Infinity LC超高效液相色谱系统HILIC色谱柱;质谱仪为Triple TOF 5600质谱仪。
4.根据权利要求1所述的系统性硬化症诊断的脂肪酸代谢物分析检测方法,其特征在于:质谱分析时,样品加入100μL乙腈水溶液复溶,其中乙腈:水=1:1(v/v),涡旋,14000g4℃离心15min,取上清液进样分析。
5.根据权利要求1所述的系统性硬化症诊断的脂肪酸代谢物分析检测方法,其特征在于:每个待测样本等量混合用于制备质控QC样本,用于测定进样前仪器状态及平衡色谱-质谱系统,并用于评价整个实验过程中系统稳定性,剩余待测样进行色谱-质谱检测。
6.根据权利要求1所述的系统性硬化症诊断的脂肪酸代谢物分析检测方法,其特征在于:原始数据经ProteoWizard转换成.mzXML格式,然后采用XCMS程序进行峰对齐、保留时间校正和提取峰面积,代谢物结构鉴定采用精确质量数匹配<25ppm和二级谱图匹配的方式,检索实验室自建数据库,对XCMS提取得到的数据,删除组别总和>2/3的离子峰。
7.根据权利要求6所述的系统性硬化症诊断的脂肪酸代谢物分析检测方法,其特征在于:应用软件SIMCA-P14.1,Umetrics,Umea,Sweden,进行模式识别,数据经Pareto-scaling预处理后,进行多维统计分析。
8.根据权利要求7所述的系统性硬化症诊断的脂肪酸代谢物分析检测方法,其特征在于:所述多维统计分析包括无监督主成分分析PCA,有监督偏最小二乘法判别分析PLS-DA和正交偏最小二乘法判别分析OPLS-DA,单维统计分析包括Student’s t-test和变异倍数分析,R软件绘制火山图;以VIP>1为筛选标准,初步筛选出各组间的差异物。
9.根据权利要求8所述的系统性硬化症诊断的脂肪酸代谢物分析检测方法,其特征在于:采用单变量统计分析,验证差异代谢物是否具有显著性,选择同时具有多维统计分析VIP>1和单变量统计分析P value<0.05的代谢物,作为具有显著性差异的代谢物;而VIP>1且0.05<P value<0.1则作为差异代谢物。
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