[发明专利]血清抗FadA抗体的检测及相关诊断方法

说明书

本发明涉及检测来自患者的测试样品中的血清抗FadA抗体。此外，本发明的各方面为来自测试样品的血清抗FadA抗体水平的检测和与各种临床相关病症的关联性提供了基础。

政府支持声明

本发明是在美国国家癌症研究院(National Cancer Institute，NCI)授予的基金号RO1CA192111的政府支持下做出的。美国政府在本发明中具有一定权利。

技术领域

本发明涉及检测测试样品中的血清抗FadA抗体。此外，本发明的各方面为来自测试样品的血清抗FadA抗体水平的检测和与各种临床相关病症的关联性提供了基础。

背景技术

具核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum，Fn)是一种长丝状革兰氏阴性厌氧菌，在口腔中普遍存在。它在与不同口腔感染(包括牙龈炎、牙周炎和牙髓感染)相关的生物膜中非常普遍(Han YW,2015)。作为一种机会致病菌，它存在于牙周健康部位以及患病部位，其中在患病部位的数量超过在健康部位的数量(Moore WE,Moore LV.2000)。

在口腔之外，在正常状况下Fn不存在或很少被检测到(Aagaard K等人2012；Segata N.等人,2012)。然而，在疾病状况下，Fn是参与器官脓肿、动脉粥样硬化、妊娠并发症、类风湿性关节炎、呼吸道感染和胃肠道疾病(例如结肠直肠癌(CRC)、炎性肠病和阑尾炎)的最普遍物种之一(Han YW和Wang X.2013；Han YW,2015)。

在多种人类疾病中对Fn的发现部分是由于微生物检测技术的发展，这种发展允许鉴定数目越来越多的以前被忽视的微生物。

以前的结果证明Fn通过其独特的粘附蛋白FadA(梭杆菌粘附蛋白A)特异性刺激结肠直肠肿瘤发生。美国专利申请号20140206011中描述了与编码FadA的DNA和mRNA的检测以及与CRC的关联性相关的最初发现。

然而，对于Fn感染或定殖的快速可靠的诊断和有用于评估与不良妊娠结果相关的病症以及结肠直肠癌(CRC)和相关癌症的风险的关联性，仍存在需求。

本发明的实施方案为血清抗FadA抗体的检测和与各种临床相关病症的关联性提供了基础。

发明内容

在某些实施方案中，本发明涉及一种检测患者的具核梭杆菌(Fn)定殖情况的方法，其包括：a)从患者获得样品；和b)使所述患者样品与能够结合抗梭杆菌粘附蛋白A(FadA)抗体的结合剂相接触，并且c)检测所述抗FadA患者抗体与所述结合剂之间的结合。

在某些实施方案中，本发明涉及一种检测患者样品中的血清抗梭杆菌粘附蛋白A(FadA)抗体的方法，其包括：a)从患者获得样品；b)将所述患者样品与能够结合抗FadA抗体的结合剂相接触，并且c)检测所述抗FadA患者抗体与所述结合剂之间的结合。

在某些实施方案中，本发明涉及一种检测患者的结肠直肠癌前阶段的方法，其包括：a)使患者样品与能够结合抗梭杆菌粘附蛋白A(FadA)抗体的结合剂相接触；b)检测所述抗FadA患者抗体与所述结合剂之间的结合；并且c)进一步确定抗FadA患者抗体的检测水平是否升高到高于基线或参比水平，其中抗FadA患者抗体升高到高于基线水平指示所述患者处于结肠直肠癌的癌前阶段。

在某些实施方案中，所述患者是哺乳动物。

在某些实施方案中，通过检测到抗FadA患者抗体的基线值或不存在，将所述患者鉴定为未被具核梭杆菌定殖。

在某些实施方案中，所述方法进一步包括在检测到针对FadA的血清抗体的患者水平高于基线水平的基础上，确定所述动物具有早期、中度或慢性具核梭杆菌(Fn)感染。