[发明专利]环状RNA快速富集试剂盒及方法在审

专利信息
申请号: 201910137907.5 申请日: 2019-02-25
公开(公告)号: CN111607588A 公开(公告)日: 2020-09-01
发明(设计)人: 戴梅芳 申请(专利权)人: 上海印序生物科技有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 上海宏京知识产权代理事务所(普通合伙) 31297 代理人: 周高
地址: 200233 上海市徐*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 环状 rna 快速 富集 试剂盒 方法
【说明书】:

发明公开了一种环状RNA快速富集试剂盒,该试剂盒包括无核糖核酸酶水、探针杂交缓冲液、探针组及纯化试剂;所述试剂盒配套含有磁力架;其中,所述探针组所包含的探针的序列5’端均经过生物素修饰;其中,探针杂交缓冲液为由浓度为100nM的NaCl、浓度为1mM的MgCl2及浓度为1mM的Tris组成的水溶液。本发明环状RNA快速富集效果稳定,提高了环状RNA的检出率,避免了因Rnase R不耐受而导致的环状RNA丢失,纯化富集流程简单,可一步同时去除rRNA和其他线性RNA,实验周期短,1个小时内即可完成,样品损耗低。

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域,尤其涉及一种环状RNA快速富集试剂盒及方法。

背景技术

环状RNA(circular RNA,circRNA)是具有闭合环状结构的一类新型RNA分子,颠覆了RNA都是线性分子的传统理论。环状RNA稳定性好,能在血浆、唾液、尿液等体液中稳定存在,是一种新型疾病分子标志物。研究环状RNA可以帮助我们全面解析疾病信号通路,开发新型临床诊断方法,寻找疾病治疗新靶点,在科研和临床领域均具有重要意义。

真核转录组中除了环状RNA外,还包含多种其它类型的RNA分子,如:核糖体RNA(rRNA),信使RNA(mRNA)和长链非编码RNA(LncRNA)。其中,rRNA的比例高达80%以上,mRNA的比例约1%-5%,而环状RNA的比例不足0.5%。为了准确的检测和鉴定环状RNA,需要从总RNA中去除其它无关RNA,特异性对环状RNA进行纯化和富集。

目前,市场上还没有针对环状RNA纯化富集的试剂盒。市场上现有环状RNA纯化富集方法主要包括以下步骤:1、通过去rRNA试剂盒去除总RNA中的rRNA;2、通过Rnase R对去除rRNA后的样品进行消化;3、将步骤2中所得消化后的RNA样品进行纯化回收。

上述环状RNA富集纯化方法主要存在以下问题:

1.Rnase R不稳定,不同批次酶活差异极大,从而易导致环状RNA纯化富集效果不稳定;

2.Rnase R不仅能消化线性RNA,还能消化部分环状RNA,从而可导致环状RNA纯化富集过程中部分环状RNA的丢失;

3.流程繁琐,实验周期需3~4小时,费时费力,样品损耗大。

发明内容

本发明的目的是克服上述不足,提供了一种环状RNA快速富集试剂盒及方法,环状RNA纯化富集效果稳定,提高了环状RNA的检出率,避免了因Rnase R不耐受而导致的环状RNA丢失,纯化富集流程简单,可一步同时去除rRNA和其他线性RNA,实验周期短,仅需1个小时即可完成,样品损耗低。

为实现上述目的,本发明提供如下技术方案,

本发明第一方面提供了环状RNA快速富集试剂盒,包括无核糖核酸酶水、探针杂交缓冲液、探针组及纯化试剂;所述试剂盒配套含有磁力架;其中,所述探针组所包含的探针的序列5’端均经过生物素修饰。

优选的,所述探针杂交缓冲液为由浓度为100nM的NaCl、浓度为1mM的MgCl2及浓度为1mM的Tris组成的水溶液,所述探针杂交缓冲液pH为7.5。

优选的,所述纯化试剂为链酶亲和素磁珠悬浮液及RNA纯化磁珠。

进一步的,所述链酶亲和素磁珠悬浮液为由浓度为100mM的NaCl和浓度为5mM的Tris组成的水溶液,所述链酶亲和素磁珠悬浮液pH为7.0。

优选的,所述纯化试剂为亲和素磁珠悬浮液及RNA纯化磁珠。

进一步的,所述亲和素磁珠悬浮液为由浓度为100mM的NaCl和浓度为5mM的Tris组成的水溶液,所述亲和素磁珠悬浮液pH为7.0。

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