[发明专利]环状RNA快速富集试剂盒及方法在审

专利信息
申请号: 201910137907.5 申请日: 2019-02-25
公开(公告)号: CN111607588A 公开(公告)日: 2020-09-01
发明(设计)人: 戴梅芳 申请(专利权)人: 上海印序生物科技有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 上海宏京知识产权代理事务所(普通合伙) 31297 代理人: 周高
地址: 200233 上海市徐*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 环状 rna 快速 富集 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.环状RNA快速富集试剂盒,其特征在于,包括无核糖核酸酶水、探针杂交缓冲液、探针组及纯化试剂;所述试剂盒配套含有磁力架;其中,所述探针组所包含的探针的序列5’端均经过生物素修饰。

2.如权利要求1所述的环状RNA快速富集试剂盒,其特征在于,所述探针杂交缓冲液为由浓度为100nM的NaCl、浓度为1mM的MgCl2及浓度为1mM的Tris组成的水溶液,所述探针杂交缓冲液pH为7.5。

3.如权利要求2所述的环状RNA快速富集试剂盒,其特征在于,所述纯化试剂为链酶亲和素磁珠悬浮液及RNA纯化磁珠。

4.如权利要求3所述的环状RNA快速富集试剂盒,其特征在于,所述链酶亲和素磁珠悬浮液为由浓度为100mM的NaCl和浓度为5mM的Tris组成的水溶液,所述链酶亲和素磁珠悬浮液pH为7.0。

5.如权利要求2所述的环状RNA快速富集试剂盒,其特征在于,所述纯化试剂为亲和素磁珠悬浮液及磁珠。

6.如权利要求5所述的环状RNA快速富集试剂盒,其特征在于,所述亲和素磁珠悬浮液为由浓度为100mM的NaCl和浓度为5mM的Tris组成的水溶液,所述亲和素磁珠悬浮液pH为7.0。

7.利用权利要求3或5任一所述的试剂盒快速富集环状RNA的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:

S1、探针杂交

S1.1、将5μg样本RNA溶于无核糖核酸酶水内,得到样品溶液,其中,所述无核糖核酸酶水体积小于20μL;

S1.2、将探针组内生物素标记的各探针溶解后混合,得到探针组溶液;

S1.3、分别将25μL探针杂交缓冲液、步骤S1.1中所得样品溶液、步骤S1.2所得1μL探针组溶液依次加入灭菌离心管中,搅拌混合均匀后通过无核糖核酸酶水定容至50μL,于70℃变性2~5min,快速转移冰浴;

S1.4、将步骤S1.3中所得溶液在37℃孵育10~30分钟得到环状RNA纯化反应体系;

S2、链酶亲和素磁珠清洗

S2.1、向离心管中加入150μL链酶亲和素磁珠悬浮液并放置于磁力架上静置1~2分钟,吸弃上清;

S2.2、将步骤S2.1中所得吸弃上清的链酶亲和素磁珠从磁力架上移开,加入200μL无核糖核酸酶水,震荡均匀,放置于磁力架上静置1~2分钟,吸弃上清;

S2.3、将步骤S2.2中所得吸弃上清的链酶亲和素磁珠悬浮液重复步骤S2.1及步骤S2.2一次;

S2.4、将步骤S2.3中所得吸弃上清的链酶亲和素磁珠在90μL探针杂交缓冲液内重悬浮沉淀,待溶液澄清后吸弃上清;

S2.5、将步骤S2.4中所得吸弃上清的链酶亲和素磁珠悬浮液在50μL探针杂交缓冲液内重悬浮沉淀,待溶液澄清后吸弃上清,放置于37℃水浴中保存;

S3、环状RNA纯化

S3.1、将步骤S1.4中所得环状RNA纯化反应体系加入步骤S2.5中所得链酶亲和素磁珠悬浮液中,低速震荡混匀,37℃孵育5~20分钟,室温静置于磁力架上1~2分钟,将上清液转移至1.5mL离心管内;

S3.2、从冰箱中拿出RNA纯化磁珠,使其温度恢复至室温并搅拌均匀;

S3.3、向步骤S3.1中所得盛有上清液的离心管内加入220μL步骤S3.2所得RNA纯化磁珠,吹打混匀,冰上放置5~15分钟;

S3.4、将经步骤S3.3处理后的离心管放置于磁力架上1~2分钟,待溶液澄清后吸弃上清;

S3.5、将经步骤S3.4处理后的离心管继续放置于磁力架上,加入200μL75%乙醇,吸弃上清;

S3.6、将经步骤S3.5所得吸弃上清的离心管继续放置于磁力架上,加入200μL75%乙醇,吸弃上清;

S3.7、将经步骤S3.6处理后的离心管开盖静置2~5分钟,使磁珠干燥;

S3.8、加入10μL无核糖核酸酶水至经步骤S3.7处理后的离心管内,吹吸混匀10次,静置于磁力架上1~2分钟,转移8μL上清至新的0.2mL离心管中,所得上清液即为纯化富集后的环状RNA。

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