[发明专利]RNA纯化试剂盒及富集miRNA的方法在审
申请号: | 201910020384.6 | 申请日: | 2019-01-09 |
公开(公告)号: | CN109679947A | 公开(公告)日: | 2019-04-26 |
发明(设计)人: | 刘标;杨旭;吴莉萍;辜清泉;姜盼盼 | 申请(专利权)人: | 深圳瑞奥康晨生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12N15/113;C12Q1/6806 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 张海平;彭家恩 |
地址: | 518008 广东省深圳市盐田区海山*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 试剂盒 富集 悬浮溶液 玻璃粉 酸处理 总RNA 缓冲剂 申请 选择性富集 血清miRNA 测序过程 后续处理 试剂处理 提取纯化 超纯水 高通量 离液盐 建库 溶质 血浆 | ||
本申请涉及一种RNA纯化试剂盒,包括酸处理玻璃粉和悬浮溶液,该酸处理玻璃粉具有325目或更细的粒度,该悬浮溶液以超纯水为溶质,包含0.2‑1M的离液盐和0.05‑0.2M的缓冲剂,pH 5‑7。本申请还涉及一种从含有总RNA的水溶液中富集miRNA的方法,包括使用本发明RNA纯化试剂盒中的酸处理玻璃粉和悬浮溶液配成的RNA纯化试剂处理含有总RNA的水溶液,经后续处理而从总RNA富集miRNA。本申请的RNA纯化试剂盒和miRNA富集方法成本低,操作相对简单,miRNA提取纯度高,提取损失小,减少后续高通量建库测序过程中的试剂和数据浪费,尤其适用于血浆或血清miRNA的提取纯化和选择性富集。
技术领域
本发明涉及生化纯化技术领域,具体涉及一种RNA纯化试剂盒及一种富集miRNA的方法。
背景技术
miRNA(MicroRNA)是一类非编码单链小RNA,一般由18-23个核苷酸组成。作为微型调节分子,miRNA通过与信使RNA(mRNA)的3’-UTR区域特异结合,抑制蛋白翻译或者直接导致mRNA降解,在转录后水平调控蛋白质的表达。miRNA参与细胞的增殖、分化、凋亡等各类重大的生化过程,在人体中的表现就是在一些重大疾病如心血管疾病、肿瘤的发生发展过程中发挥调控功能。研究发现,成熟的miRNA能够稳定存在于血浆或血清中,可以为心血管疾病等的诊断和预后提供重要线索。
为了检测血浆或血清中miRNA的表达水平,首先需要从血浆或血清样本中提取得到纯度高、总量足的miRNA。目前常见的血浆或血清RNA提取方法主要分为两类,一类是专门的提取试剂盒,如QIAGEN的QIAampCircuLating NucleicAcidKit、Thermo的mirVanaTMPARISTMKit等,另一类是常规的总RNA提取试剂,如Thermo的TrizolLS、TrizolReagent等。
QIAGEN的QIAampCircuLatingNucleicAcidKit主要采用硅酸盐基质膜吸附的方式,对血浆或血清中的RNA进行富集。血浆或血清样本经过裂解液处理后,通过离心将核酸特异性的结合到QIAamp离心柱上,并通过后续的清洗步骤,将样品中的蛋白质、PCR抑制物、污染物等去除,最后经过洗脱,获得纯化的核酸样品。同时,可以结合试剂盒配套的RNase-FreeDNaseSet进行DNA的柱上消化,确保获得的核酸样品中无DNA污染。
Thermo的mirVanaTMPARISTMKit分离试剂盒采用玻璃纤维吸附的方法,可以从组织、细胞及血浆和血清中分离各种类型RNA,如总RNA、mRNA、miRNA、小分子干扰RNA(siRNA)和核内小分子RNA(snRNA)等。此试剂盒采用有机溶剂提取技术,并利用特制的结合溶液与洗涤溶液进行玻璃纤维滤膜纯化,从而获得高纯度的RNA样品。
Thermo的TrizolLS和TrizolReagent属于常规的RNA提取试剂,主要成分苯酚是组织或细胞裂解剂,也含有8-羟基喹啉、异硫氰酸胍、β-巯基乙醇等RNA酶(RNase)抑制剂。Trizol提取过程中,利用酸性的水相环境获得高纯度的RNA水溶液,并通过氯仿抽提的过程去除DNA、蛋白质等杂质,最后使用乙醇或异丙醇醇沉,获得总RNA样品。
目前现有的技术中,专门用于血浆或血清RNA提取的试剂盒价格昂贵,虽然能够获得纯度较高的血浆或血清RNA产物,但往往步骤繁琐,得率较低,且无RNA类型或片段长度的特异性。另外,基于滤膜吸附过滤的富集方法,往往受限于膜的制作工艺,造成片段长度较小的RNA在离心过程中的丢失,不利于miRNA的检测。在后续的检测过程中,无长度特异性的提取产物中非miRNA的其他类型RNA往往会占用较多的试剂和数据资源,导致成本的进一步升高。常规的RNA提取试剂如Thermo的Trizol LS和Trizol Reagent,价格较为便宜,一般得率也较高,但是对于污染物的除去效果较差,同时也无法仅通过提取流程区分不同类型、不同片段长度的RNA。
发明内容
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