[发明专利]在癌症筛查、诊断、治疗和复发中利用巨细胞核酸表征的方法

权利要求书

1.测定巨细胞或巨大裸核或两者中的癌症相关分子变化的方法，所述方法包括：

从受试者的生物样本中分离巨细胞或巨大裸核或两者，以及

对巨细胞和/或巨大裸核分析癌症相关分子变化，从而分析巨细胞或巨大裸核或两者中的癌症相关分子变化。

2.根据权利要求1所述的方法，其中，癌症相关的分子变化是突变，表观遗传修饰或两者。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中使用以下一种或多种从生物样本中分离巨细胞和/或巨大裸核：(i)尺寸排阻方法、(ii)分析物捕获元素、(iii)红细胞裂解以及(iv)白细胞耗竭。

4.根据权利要求3所述的方法，其中，所述尺寸排阻方法是保留8微米或更大的细胞的过滤器。

5.根据权利要求3所述的方法，其中，所述分析物捕获元素是识别巨细胞和/或巨大裸核的细胞表面或细胞内标志物的抗体。

6.根据权利要求1-5中任一项所述的方法，其中，所述核酸是完整或未降解的核酸。

7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法，其中，所述分析是在单个巨细胞、两个或多个巨细胞组、单个巨大裸核、两个或多个巨大裸核组、或其组合上进行的。

8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，进一步包括测定循环肿瘤细胞(CTC)、循环内皮细胞(CEC)和上皮间充质转化细胞(EMT)中的一种或多种中的癌症相关分子变化，其中从生物样本中分离所述CTC、CEC和EMT，连同从生物样本分离巨细胞和/或巨大裸核。

9.测定巨细胞或巨大裸核或两者中的癌症相关分子变化的方法，所述方法包括：

使从受试者获得的生物样本经历尺寸排阻方法，其中收集尺寸为8微米或更大的细胞和裸核，其中所收集的细胞和裸核包括巨细胞或巨大裸核或两者，和

对收集的细胞和/或裸核分析癌症相关分子变化，从而分析巨细胞或巨大裸核或两者中的癌症相关分子变化。

10.根据权利要求9所述的方法，其中，癌症相关的分子变化是突变，表观遗传修饰或两者。

11.根据权利要求9或10所述的方法，其中，所收集的细胞和裸核包括CTC、CTC的裸核、CEC、CEC的裸核、EMT和EMT的裸核中的一种或多种。

12.根据权利要求9-11中任一项所述的方法，其中，分析所有收集的细胞和裸核的癌症相关分子变化。

13.根据权利要求9-11中任一项所述的方法，其中，当识别癌症相关分子变化时，还包括基于癌症有关分子变化的身份进行预后。

14.根据权利要求9-11中任一项所述的方法，其中，当识别癌症相关分子变化时，还包括基于癌症有关分子变化的身份预测治疗反应。

15.根据权利要求9-11中任一项所述的方法，其中，当识别癌症相关分子变化时，还包括诊断受试者为患有癌症。

16.根据权利要求9-11中任一项所述的方法，其中，当识别癌症相关分子变化时，还包括诊断受试者的癌症复发。

17.用于确定对癌症治疗的抗性的方法，所述方法包括：

从受试者的生物样本中分离巨细胞或巨大裸核或两者，

分析巨细胞和/或巨大裸核，以获得第二组癌症相关分子变化，

比较第二组癌症相关分子变化与第一组癌症相关分子变化，所述第一组癌症相关分子变化在较早时间从受试者获得的相似生物样本中的巨细胞和/或巨大裸核获得，

其中当第一和第二组癌症相关分子变化的身份不同时，确定所述受试者对癌症治疗具有抗性。