[发明专利]环状DNA的复制或扩增方法在审
申请号: | 201880018564.4 | 申请日: | 2018-02-28 |
公开(公告)号: | CN110446783A | 公开(公告)日: | 2019-11-12 |
发明(设计)人: | 末次正幸;奈良圣亚 | 申请(专利权)人: | 奥利希罗基因组学有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 何杨 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 环状DNA 扩增 催化 复制 复制起始序列 无细胞系统 片段连接 多聚体 副产物 转座子 组复制 连体 链环 合成 | ||
1.一种无细胞系统中的环状DNA的复制方法,其包含以下的工序:
工序(1):形成成为模板的环状DNA与反应液的反应混合物,所述反应液包含以下组分:
催化环状DNA的复制的第一酶组、
催化冈崎片段连接反应而合成形成环连体的2个姊妹环状DNA的第二酶组、和
催化2个姊妹环状DNA的分离反应的第三酶组;和
工序(2):使工序(1)中形成的反应混合物进行反应;
其中,该环状DNA包含能够与具有DnaA活性的酶结合的复制起始序列(origin ofchromosome(oriC))、并且还包含分别相对于oriC向外插入的1对ter序列和/或被DNA多聚体分离酶识别的碱基序列,
其中,在该环状DNA具有ter序列的情况下,所述工序(1)的反应液还包含具有结合于ter序列而抑制复制的活性的蛋白质,并且,在该环状DNA具有DNA多聚体分离酶识别的碱基序列的情况下,所述工序(1)的反应液还包含DNA多聚体分离酶。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,DNA多聚体分离酶为Cre或XerCD。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中,就分别相对于oriC向外插入的1对ter序列而言,作为一方的ter序列在oriC的5’侧插入有包含序列号1~14所示的序列中的任一序列的序列、作为另一方的ter序列在oriC的3’侧插入有包含序列号1~14所示的序列的互补序列的序列。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中,具有结合于ter序列而抑制复制的活性的蛋白质为Tus蛋白或RTP蛋白。
5.根据权利要求2所述的方法,其中,XerCD识别的碱基序列为包含序列号15~24所示的序列中的任一序列的序列或其互补序列。
6.根据权利要求2所述的方法,其中,Cre识别的碱基序列为包含序列号30~35所示的序列中的任一序列的序列或其互补序列。
7.一种核酸,为具有273bp~2.0kb的长度的线状DNA,包含oriC、以及分别相对于oriC向外插入的1对ter序列和/或DNA多聚体分离酶识别的碱基序列。
8.一种无细胞系统中的环状DNA的复制方法,其包含以下的工序:
工序(1):将oriC转座子和转座酶添加到缓冲液中而形成oriC转座体,其中,oriC转座子为包含能够与具有DnaA活性的酶结合的复制起始序列(origin of chromosome(oriC))的线状DNA且其两末端包含外端(OE)序列;和
使oriC转座体和不含oriC的环状DNA在缓冲液中进行反应,进行转移反应;
由此制备包含oriC的环状DNA;
工序(2):形成(1)中得到的包含oriC的环状DNA与反应液的反应混合物,所述反应液包含以下组分:
催化环状DNA的复制的第一酶组、
催化冈崎片段连接反应而合成形成环连体的2个姊妹环状DNA的第二酶组、和
催化2个姊妹环状DNA的分离反应的第三酶组;和
工序(3):使工序(2)中形成的反应混合物进行反应。
9.根据权利要求8所述的方法,其中,OE序列包含序列号25(5’-CTGTCTCTTATACACATCT-3’)所示的序列及其互补序列,在工序(1)的线状DNA的5’末端插入有包含序列号25所示的序列的OE序列,在该线状DNA的3’末端插入有包含序列号25所示的序列的互补序列的OE序列。
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