[发明专利]环状DNA的复制或扩增方法在审

专利信息
申请号: 201880018564.4 申请日: 2018-02-28
公开(公告)号: CN110446783A 公开(公告)日: 2019-11-12
发明(设计)人: 末次正幸;奈良圣亚 申请(专利权)人: 奥利希罗基因组学有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 代理人: 何杨
地址: 日本*** 国省代码: 日本;JP
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摘要:
搜索关键词: 环状DNA 扩增 催化 复制 复制起始序列 无细胞系统 片段连接 多聚体 副产物 转座子 组复制 连体 链环 合成
【权利要求书】:

1.一种无细胞系统中的环状DNA的复制方法,其包含以下的工序:

工序(1):形成成为模板的环状DNA与反应液的反应混合物,所述反应液包含以下组分:

催化环状DNA的复制的第一酶组、

催化冈崎片段连接反应而合成形成环连体的2个姊妹环状DNA的第二酶组、和

催化2个姊妹环状DNA的分离反应的第三酶组;和

工序(2):使工序(1)中形成的反应混合物进行反应;

其中,该环状DNA包含能够与具有DnaA活性的酶结合的复制起始序列(origin ofchromosome(oriC))、并且还包含分别相对于oriC向外插入的1对ter序列和/或被DNA多聚体分离酶识别的碱基序列,

其中,在该环状DNA具有ter序列的情况下,所述工序(1)的反应液还包含具有结合于ter序列而抑制复制的活性的蛋白质,并且,在该环状DNA具有DNA多聚体分离酶识别的碱基序列的情况下,所述工序(1)的反应液还包含DNA多聚体分离酶。

2.根据权利要求1所述的方法,其中,DNA多聚体分离酶为Cre或XerCD。

3.根据权利要求1或2所述的方法,其中,就分别相对于oriC向外插入的1对ter序列而言,作为一方的ter序列在oriC的5’侧插入有包含序列号1~14所示的序列中的任一序列的序列、作为另一方的ter序列在oriC的3’侧插入有包含序列号1~14所示的序列的互补序列的序列。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中,具有结合于ter序列而抑制复制的活性的蛋白质为Tus蛋白或RTP蛋白。

5.根据权利要求2所述的方法,其中,XerCD识别的碱基序列为包含序列号15~24所示的序列中的任一序列的序列或其互补序列。

6.根据权利要求2所述的方法,其中,Cre识别的碱基序列为包含序列号30~35所示的序列中的任一序列的序列或其互补序列。

7.一种核酸,为具有273bp~2.0kb的长度的线状DNA,包含oriC、以及分别相对于oriC向外插入的1对ter序列和/或DNA多聚体分离酶识别的碱基序列。

8.一种无细胞系统中的环状DNA的复制方法,其包含以下的工序:

工序(1):将oriC转座子和转座酶添加到缓冲液中而形成oriC转座体,其中,oriC转座子为包含能够与具有DnaA活性的酶结合的复制起始序列(origin of chromosome(oriC))的线状DNA且其两末端包含外端(OE)序列;和

使oriC转座体和不含oriC的环状DNA在缓冲液中进行反应,进行转移反应;

由此制备包含oriC的环状DNA;

工序(2):形成(1)中得到的包含oriC的环状DNA与反应液的反应混合物,所述反应液包含以下组分:

催化环状DNA的复制的第一酶组、

催化冈崎片段连接反应而合成形成环连体的2个姊妹环状DNA的第二酶组、和

催化2个姊妹环状DNA的分离反应的第三酶组;和

工序(3):使工序(2)中形成的反应混合物进行反应。

9.根据权利要求8所述的方法,其中,OE序列包含序列号25(5’-CTGTCTCTTATACACATCT-3’)所示的序列及其互补序列,在工序(1)的线状DNA的5’末端插入有包含序列号25所示的序列的OE序列,在该线状DNA的3’末端插入有包含序列号25所示的序列的互补序列的OE序列。

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