[发明专利]具备假阳性抑制功能的探针、其设计方法及其应用在审

专利信息
申请号: 201880013218.7 申请日: 2018-02-20
公开(公告)号: CN110325639A 公开(公告)日: 2019-10-11
发明(设计)人: 新岛结;高濑信太郎;铃木久史;池田寿文 申请(专利权)人: 株式会社友华
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/6876
代理公司: 北京市金杜律师事务所 11256 代理人: 杨宏军;焦成美
地址: 日本*** 国省代码: 日本;JP
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摘要:
搜索关键词: 多核苷酸 碱基探针 靶序列 脱碱基化 序列互补 假阳性 短链 核酸 碱基 双链 探针 检测 应用
【权利要求书】:

1.多核苷酸碱基探针,所述探针具有下述序列:

在与具有至少1条序列号1~10中任一序列的靶序列互补的序列中,与所述靶序列中的该序列号1~10中任一序列互补的部分中的至少1个碱基经脱碱基化和/或经取代,

并且/或者,

经切割从而在末端具有至少1段下述互补序列,所述互补序列与所述靶序列中的序列号1~10中任一序列的2个碱基以下的序列互补。

2.如权利要求1所述的多核苷酸碱基探针,所述多核苷酸碱基探针为10~50mer。

3.如权利要求2所述的多核苷酸碱基探针,所述多核苷酸碱基探针为15~28mer。

4.如权利要求1~3中任一项所述的多核苷酸碱基探针,其结合有标记。

5.如权利要求1~4中任一项所述的多核苷酸碱基探针,其中,在与所述靶序列中的序列号1~10中任一序列互补的部分中,所述经脱碱基化或经取代的碱基中的至少1个位于与所述靶序列中的所述序列号1~10中任一序列互补的部分的内部。

6.如权利要求1~5中任一项所述的多核苷酸碱基探针,其特征在于,在与所述靶序列中的序列号1~10中任一序列互补的序列中,所述经脱碱基化或经取代的碱基中的至少1个的比例为相对于3~5个的鸟嘌呤或胞嘧啶中的某一方而言为1个。

7.如权利要求1~6中任一项所述的多核苷酸碱基探针,其中,所述靶核酸为10~50mer的DNA或RNA。

8.如权利要求7所述的多核苷酸碱基探针,其中,所述靶核酸为miRNA。

9.如权利要求1~8中任一项所述的多核苷酸碱基探针,所述多核苷酸碱基探针为DNA、RNA、LNA、GNA、BNA或PNA。

10.多核苷酸碱基探针序列的设计方法,所述多核苷酸碱基探针能以高特异度与具有至少1条序列号1~10中任一序列的靶序列结合,所述方法包括下述步骤:

步骤A),将与所述靶序列完全互补的10~50mer的序列选用为完全互补探针序列;

步骤B),(i)对所述完全互补探针序列中与所述靶序列中的序列号1~10中任一序列互补的部分中的至少1个碱基进行脱碱基化和/或取代,由此设计所述多核苷酸碱基探针序列,及/或,

(ii)对所述完全互补探针序列的末端进行切割,以使得所述完全互补探针序列中与所述靶序列中的序列号1~10中任一序列互补的部分为2个碱基以下,由此设计所述多核苷酸碱基探针序列。

11.对被测样品中的下述靶核酸以高特异度进行检测或定量的方法,所述靶核酸具有至少1条序列号1~10中的任一序列,所述方法包括下述步骤:

制备用于检测所述靶核酸的被测样品的步骤;

使至少1种权利要求1~9中任一项所述的多核苷酸碱基探针与所述被测样品接触的步骤;及

对与所述多核苷酸碱基探针结合的所述靶核酸进行检测或定量的步骤。

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