[发明专利]瓢鸡无尾基因及检测瓢鸡无尾性状的方法、引物、试剂盒在审
| 申请号： | 201811333356.1 | 申请日： | 2018-11-09 |
| 公开（公告）号： | CN109295052A | 公开（公告）日： | 2019-02-01 |
| 发明（设计）人： | 史宪伟;王欣;陈多珍;李杨;杨向东;罗袁山 | 申请（专利权）人： | 云南农业大学 |
| 主分类号： | C12N15/11 | 分类号： | C12N15/11;C12Q1/6888 |
| 代理公司： | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人： | 苗艳荣 |
| 地址： | 650201 云*** | 国省代码： | 云南;53 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 鸡无 性状 基因 试剂盒 引物 分子标记辅助育种 遗传变异分析 功能基因 关联分析 基因检测 检测标记 快速鉴定 良种繁育 全基因组 位置克隆 序列测定 载体技术 低成本 检测 可用 省时 突变 筛选 | ||
1.一种瓢鸡无尾基因，其特征在于，所述瓢鸡无尾基因及其位置克隆为IRX1；所述IRX1的基因检测标记，其为Mbo II标记和Ava II标记，其中Mbo II标记为SEQ ID No.1所示序列5’端起2540位SNP的G或A；Ava II标记为SEQ ID No.1所示序列5’端起4524位SNP的C或A。
2.一种应用权利要求1所述瓢鸡无尾基因的检测瓢鸡无尾性状的方法，其特征在于，所述检测瓢鸡无尾性状的方法通过检测IRX1基因的Mbo II标记和Ava II标记，确定瓢鸡的无尾和有尾性状。
3.如权利要求2所述的检测瓢鸡无尾性状的方法，其特征在于，所述检测瓢鸡无尾性状的方法具体包括：Mbo II标记的GG基因型与GA基因型为无尾性状，AA基因型为有尾性状。MboⅡ检测标记的GG基因型为500bp一个片段，AA基因型为252bp、248bp的2个片段，GA基因型为500bp、250bp、248bp的3个片段；Ava II标记的AA基因型与AC基因型为无尾性状，CC基因型为有尾性状。AvaⅡ检测标记的AA基因型为639bp、177bp 2个片段，CC基因型为318bp、321bp和177bp的3个片段，CA基因型为639bp、318bp、321bp和177bp的4个片段。
4.如权利要求3所述的检测瓢鸡无尾性状的方法，其特征在于，Hap5和Hap8是无尾鸡性状特有单倍型，Hap3、Hap4、Hap7、Hap9是有尾性状特有单倍型，Hap1是无尾性状优势单倍型，Hap2是有尾性状优势单倍型。其中，Hap1的SNP组合为CTACAGCCC，Hap2的SNP组合为CTGCAGCAC，Hap3的SNP组合为CTGCCGCAC，Hap4的SNP组合为CGGCCGCAC，Hap5的SNP组合为CGGTAGAAC，Hap7的SNP组合为CGGTCGCAA，Hap8的SNP组合为CGGTCAAAA，Hap9的SNP组合为CGGTCACAA。
5.一种鉴定权利要求1所述的IRX1基因检测标记的引物和检测标记，其特征在于，所述引物的核苷酸为SEQ ID No.2～7；IRX1基因检测标记Mbo II的识别碱基为SEQ ID No.8，IRX1基因检测标记Ava II的识别碱基为SEQ ID No.9。
6.一种包含权利要求5所述引物和检测标记的试剂盒。
7.一种如权利要求1所述IRX1的基因检测标记的鸡选育方法。
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