[发明专利]一种通过深度学习计算乙烷分子能量的方法在审
| 申请号: | 201811133733.7 | 申请日: | 2018-09-27 |
| 公开(公告)号: | CN109147877A | 公开(公告)日: | 2019-01-04 |
| 发明(设计)人: | 周立川;崔洪光;蒋瑞;魏俊峰 | 申请(专利权)人: | 大连大学 |
| 主分类号: | G16C20/70 | 分类号: | G16C20/70;G16C20/20 |
| 代理公司: | 大连智高专利事务所(特殊普通合伙) 21235 | 代理人: | 胡景波 |
| 地址: | 116622 辽宁省*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 训练组 矩阵 乙烷分子 构型 参数输入 测试组 输出能量 构建 计算技术领域 分子空间 分子能量 能量矩阵 能量数据 随机选取 训练结果 坐标转化 矩阵行 减小 数据库 神经 学习 | ||
1.一种通过深度学习计算乙烷分子能量的方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1:构建乙烷分子数据库,所述乙烷分子数据库包含1000个不同构型乙烷分子的空间坐标和与构型对应的能量;
S2:随机选取m个构型和对应能量作为训练组,其余1000-m个构型和对应能量作为测试组;
S3:将训练组分子空间坐标转化为:各成键原子间键长,包括C-H键键长rC1-H1,rC1-H2,rC1-H3,rC2-H4,rC2-H5,rC2-H6以及C-C键键长rC1-C2;分子中连续键结三原子形成的键角,包括C-C-H所形成的键角θC2-C1-H1,θC2-C1-H2,θC2-C1-H3,θC1-C2-H4,θC1-C2-H5,θC1-C2-H6,以及H-C-H所形成的键角θH1-C1-H2,θH1-C1-H3,θH2-C1-H3,θH4-C1-H5,θH4-C1-H6,θH5-C1-H6;分子中连续键结四原子形成的二面角,为H-C-C-H所形成的二面角,包括:φH1-C1-C2-H4,φH1-C1-C2-H5,φH1-C1-C2-H6,φH2-C1-C2-H4,φH2-C1-C2-H5,φH2-C1-C2-H6,φH3-C1-C2-H4,φH3-C1-C2-H5,φH3-C1-C2-H6;非键原子间的距离,包括:rH1-H4,rH1-H5,rH1-H6,rH2-H4,rH2-H5,rH2-H6,rH3-H4,rH3-H5,rH3-H6;
令:
∑rC-H=rC1-H1+rC1-H2+rC1-H3+rC2-H4+rC2-H5+rC2-H6;
∑θC-C-H=θC2-C1-H1+θC2-C1-H2+θC2-C1-H3+θC1-C2-H4+θC1-C2-H5+θC1-C2-H6;
∑θH-C-H=θH1-C1-H2+θH1-C1-H3+θH2-C1-H3+θH4-C2-H5+θH4-C2-H6+θH5-C2-H6;
并以:∑rC-H,rC1-C2,∑θC-C-H,∑θH-C-H,∑cos3φH-C-C-H,此十一个参数组成训练组构型参数输入矩阵;
S4:提取训练组能量数据作为训练输出能量矩阵,并与训练组构型参数输入矩阵一一对应,即训练组构型参数输入矩阵R和训练组输出能量矩阵Ereal分别为:
S5:构建测试组构型参数输入矩阵和输出能量矩阵,矩阵行数为1000-m;即测试组构型参数输入矩阵R*和测试组输出能量矩阵分别为:
S6:依据训练组构型参数,采用双神经层计算结构对乙烷分子能量进行学习,经过双神经层计算得到乙烷分子能量矩阵Ecalc:
Ecalc=[tf.nn.relu(R×Win+bin)]×Wout+bout;
其中tf.nn.relu为线性整流函数,R为训练组构型参数输入矩阵,Win为第一神经层权重矩阵,bin为第一神经层偏置矩阵,Wout为第二神经层权重矩阵,bout为第二神经层偏置矩阵。
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