[发明专利]一种构建链特异RNA文库的方法及应用有效
申请号: | 201811055627.1 | 申请日: | 2018-09-11 |
公开(公告)号: | CN109234813B | 公开(公告)日: | 2021-11-16 |
发明(设计)人: | 卢文翔;王莹;涂慧珍;白云飞;顾万君;朱毅华;郑卫国 | 申请(专利权)人: | 南京迪康金诺生物技术有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C12Q1/6869;C12Q1/6806 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 蓝霞 |
地址: | 211102 江苏省南京市江宁*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 构建 特异 rna 文库 方法 应用 | ||
1.一种构建链特异RNA文库的方法,其特征在于,包括以下步骤:将RNA片段化处理得到片段化的RNA,将片段化的RNA逆转录后采用RNase H消化RNA/DNA杂合体,消化产物与接头连接得到连接产物,连接产物进行PCR扩增,扩增产物即为链特异RNA文库。
2.根据权利要求1所述的一种构建链特异RNA文库的方法,其特征在于,所述RNA为total RNA、mRNA或lncRNA。
3.根据权利要求1所述的一种构建链特异RNA文库的方法,其特征在于,所述接头的一端含有随机碱基N,所述随机碱基N的个数为3-6个。
4.根据权利要求1所述的一种构建链特异RNA文库的方法,其特征在于,所述片段化处理中加入片段化缓冲液,所述片段化缓冲液为Mg2+缓冲液。
5.根据权利要求1所述的一种构建链特异RNA文库的方法,其特征在于,消化RNA/DNA杂合体反应中还加入BSA溶液,所述BSA溶液为0.1%BSA溶液。
6.根据权利要求1所述的一种构建链特异RNA文库的方法,其特征在于,消化产物与接头连接的连接体系中包括T4DNA连接酶、接头和缓冲液。
7.根据权利要求4所述的一种构建链特异RNA文库的方法,其特征在于,所述Mg2+缓冲液包括15mM MgCl2、250mM pH8的Tris-HCl、300mM KCl、1mM DTT和10mM随机引物。
8.权利要求1所述的一种构建链特异RNA文库的方法应用于高通量RNA测序文库构建方面。
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