[发明专利]用于进行蔷薇科植物物种鉴定的片段组合、特异引物及其应用有效
| 申请号： | 201810825139.8 | 申请日： | 2018-07-25 |
| 公开（公告）号： | CN110760510B | 公开（公告）日： | 2021-08-03 |
| 发明（设计）人： | 周世良;杨雪莹;陈荀;张稳 | 申请（专利权）人： | 中国科学院植物研究所 |
| 主分类号： | C12N15/11 | 分类号： | C12N15/11;C12Q1/6895 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 关畅;秦梦楠 |
| 地址： | 100093 北京市海淀区香山*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 用于 进行 蔷薇 植物 物种 鉴定 片段 组合 特异 引物 及其 应用 | ||
1.引物组合，由引物对1至引物对8组成；
所述引物对1由引物Ros-matK-F和引物Ros-matK-R组成；
所述引物Ros-matK-F为序列表的序列1所示的单链DNA分子；
所述引物Ros-matK-R为序列表的序列2所示的单链DNA分子；
所述引物对2由引物Ros-ITS-1-F和引物Ros-ITS-1-R组成；
所述引物Ros-ITS-1-F为序列表的序列3所示的单链DNA分子；
所述引物Ros-ITS-1-R为序列表的序列4所示的单链DNA分子；
所述引物对3由引物Ros-ITS-2-F和引物Ros-ITS-2-R组成；
所述引物Ros-ITS-2-F为序列表的序列5所示的单链DNA分子；
所述引物Ros-ITS-2-R为序列表的序列6所示的单链DNA分子；
所述引物对4由引物Ros-rbcL-F和引物Ros-rbcL-R组成；
所述引物Ros-rbcL-F为序列表的序列7所示的单链DNA分子；
所述引物Ros-rbcL-R为序列表的序列8所示的单链DNA分子；
所述引物对5由引物Ros-trnH-psbA-F和引物Ros-trnH-psbA-R组成；
所述引物Ros-trnH-psbA-F为序列表的序列9所示的单链DNA分子；
所述引物Ros-trnH-psbA-R为序列表的序列10所示的单链DNA分子；
所述引物对6由引物Ros-atpB-rbcL-F和引物Ros-atpB-rbcL-R组成；
所述引物Ros-atpB-rbcL-F为序列表的序列11所示的单链DNA分子；
所述引物Ros-atpB-rbcL-R为序列表的序列12所示的单链DNA分子；
所述引物对7由引物Ros-trnL-F和引物Ros-trnL-R组成；
所述引物Ros-trnL-F为序列表的序列13所示的单链DNA分子；
所述引物Ros-trnL-R为序列表的序列14所示的单链DNA分子；
所述引物对8由引物Ros-sbeI-F和引物Ros-sbeI-R组成；
所述引物Ros-sbeI-F为序列表的序列15所示的单链DNA分子；
所述引物Ros-sbeI-R为序列表的序列16所示的单链DNA分子。
2.权利要求1所述的引物组合在辅助进行蔷薇科植物物种鉴定中的应用。
3.含有权利要求1所述引物组合的试剂盒；所述试剂盒的用途为辅助进行蔷薇科植物物种鉴定。
4.权利要求3所述试剂盒的制备方法，包括将各条引物单独包装的步骤。
5.一种蔷薇科植物物种鉴定的方法，包括如下步骤：
以待测植物基因组DNA为模板，分别采用权利要求1所述的引物组合中的引物对进行如下步骤：PCR扩增、测序、系统发育树构建和分析。
6.如权利要求5所述的方法，其特征在于：
所述系统发育树构建和分析的方法为：将待测植物得到的测序序列经过序列校对、拼接和比对后，与相应基因位点的蔷薇科数据合并，使用PAUP*4.0的Neighbor-joining算法进行系统发育树构建，通过进行1000次重复的自展分析获得各节点支持率来评估拓扑结构的可靠性。
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