[发明专利]一种可同时识别NDM-1和VIM-2的核酸适体有效
申请号: | 201810661632.0 | 申请日: | 2018-06-25 |
公开(公告)号: | CN108949766B | 公开(公告)日: | 2022-06-03 |
发明(设计)人: | 赵祖国 | 申请(专利权)人: | 广东医科大学 |
主分类号: | C12N15/115 | 分类号: | C12N15/115;C12N15/10;C12N15/11;G01N33/573 |
代理公司: | 深圳智趣知识产权代理事务所(普通合伙) 44486 | 代理人: | 崔艳峥 |
地址: | 523808 广东省东莞*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 同时 识别 ndm vim 核酸 | ||
1.一种可同时识别NDM-1和VIM-2的核酸适体APNV,其特征在于:所述核酸适体的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.根据权利要求1所述的核酸适体APNV的筛选方法,其特征在于:利用SELEX(Systematic Evolution ofLigands by Exponential Enrichment)技术从DNA文库中筛选,还包括NDM-1核酸适体和VIM-2核酸适体交替筛选步骤;
所述NDM-1核酸适体和VIM-2核酸适体交替筛选步骤如下:
(1)随机单链DNA文库的预处理:将所述DNA文库于95℃加热变性10min后立即置于冰中15min以上,用筛选缓冲液稀释至所需体积;
(2)DNA文库与酶结合:将吸附有NDM-1或VIM-2的硝酸纤维素膜浸泡于将经过预处理后的随机单链DNA文库中,并于37℃缓慢颠倒混合温育45min,取出滤膜再用洗涤缓冲液连续洗涤10次,去除未与靶分子结合及结合不牢固的单链DNA;
(3)单链DNA的制备:取步骤(2)处理后的滤膜,用灭菌后的剪刀剪碎后,加入超纯水200μl,100℃水浴处理10min,12000g离心2min,取上清作为PCR模版,用第一引物和生物素标记的第二引物进行PCR扩增,扩增产物用PCR产物纯化试剂盒进行回收,然后加入到链亲和素磁纳米磁颗粒中,室温下温育30min后,在磁力架上静置5min,去掉上清,向链亲和素纳米磁颗粒中加入200mol/L的氢氧化钠溶液,使目的单链DNA脱离纳米磁颗粒;然后在磁力架上静置后,取上清,用200mmol/L的盐酸调节pH值至6.8-7.2,所获得的单链DNA即可用于后续的筛选;所述NDM-1核酸适体及所述VIM-2核酸适体的筛选分别经过步骤(1)至(3),交替进行8轮筛选,获得可同时识别NDM-1和VIM-2的核酸适体。
3.根据权利要求2所述的筛选方法,其特征在于:所述DNA文库是随机单链DNA文库,所述随机单链DNA文库的两端为已知的引物序列、中间为35个碱基的随机序列:5’-GCAATGGTACGGTACTTCC-(N35)-CAAAGTGCACGCTACTTCGTAA-3’,N35表示35个随机核苷酸。
4.一种单链寡核苷酸,其特征在于:含有权利要求1所述的核酸适体APNV。
5.权利要求1所述的核酸适体APNV在制备NDM-1和/或VIM-2检测试剂中的应用。
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