[发明专利]一种微生物组识别方法和装置、设备

权利要求书

1.一种微生物组识别方法，包括：

获取多个生物个体的微生物组特征信息生成多个样本，计算该多个样本中第一样本分别与其他样本的相似度以获得多个相似度，根据该多个相似度建立所述第一样本的相似度概率分布模型；

获取待测样本，计算所述待测样本与所述第一样本的相似度，根据所述待测样本与所述第一样本的相似度以及所述第一样本的相似度概率分布模型确定所述待测样本的第一概率值，根据所述第一概率值判断所述待测样本与所述第一样本是否属于同一生物个体。

2.如权利要求1所述的微生物组识别方法，其特征在于，所述微生物组特征信息包括：微生物组的宏基因组测序数据，或者，微生物组的基因芯片数据，或者，微生物组的染色信息。

3.如权利要求2所述的微生物组识别方法，其特征在于，计算相似度时，如果所述微生物组的特征信息为微生物数组的宏基因组测序数据，对所述宏基因组测序数据进行k-mer分割后基于进行k-mer分割后的宏基因组测序数据进行相似度计算，k大于1。

4.如权利要求1所述的微生物组识别方法，其特征在于，所述相似度基于MinHash算法获得。

5.如权利要求1至4任一所述的微生物组识别方法，其特征在于，所述根据所述第一概率值判断所述待测样本与所述第一样本是否属于同一生物个体包括：

当所述第一概率值小于第一预设阈值时，所述待测样本与所述第一样本属于同一生物个体，当所述第一概率值大于等于第一预设阈值时，所述待测样本与所述第一样本不属于同一生物个体。

6.如权利要求1至4任一所述的微生物组识别方法，其特征在于，所述方法还包括，建立所述多个样本中除所述第一样本外的其他样本的相似度概率分布模型，获取所述待测样本与所述其他样本的相似度，根据所述待测样本与所述其他样本的相似度以及所述其他样本的相似度概率分布模型确定所述待测样本的其他概率值；

所述根据所述第一概率值判断所述待测样本与所述第一样本是否属于同一生物个体包括：对所述第一概率值和所述其他概率值进行错误发现率校正，得到校正后的第一概率值，当所述校正后的第一概率值小于第二预设阈值时，所述待测样本与所述第一样本属于同一生物个体，当所述校正后的第一概率值大于等于第二预设阈值时，所述待测样本与所述第一样本不属于同一生物个体。

7.一种微生物组识别装置，其特征在于，包括：

信息采集模块，用于获取多个生物个体的微生物组特征信息生成多个样本；

相似度计算模块，用于计算该多个样本中第一样本分别与其他样本的相似度以获得多个相似度；

相似度分布建立模块，用于根据该多个相似度建立第一样本的相似度概率分布模型；

信息采集模块，还用于获取待测样本；

相似度计算模块，还用于计算所述待测样本与所述第一样本的相似度；

识别模块，用于根据所述待测样本与所述第一样本的相似度在所述第一样本的相似度概率分布模型中的位置，判断所述待测样本与所述第一样本是否属于同一生物个体。

8.如权利要求7所述的微生物组识别装置，其特征在于，所述微生物组特征信息包括：微生物组的宏基因组测序数据，或者，微生物组的基因芯片数据，或者，微生物组的染色信息。

9.如权利要求8所述的微生物组识别装置，其特征在于，所述相似度计算模块计算相似度包括：所述微生物组的特征信息为微生物数组的宏基因组测序数据时，对所述宏基因组测序数据进行k-mer分割，k大于1，基于所述进行k-mer分割后的宏基因组测序数据计算相似度。

10.如权利要求7所述的微生物组识别装置，其特征在于，所述相似度计算模块基于MinHash算法计算相似度。