[发明专利]细菌疗法

说明书

本发明涉及包含至少一种分离的细菌和药学上可接受的赋形剂的治疗组合物，以及制备这种治疗组合物的方法。所述治疗组合物用于治疗生态失调，特别是胃肠道的生态失调。

发明领域

本发明涉及包含至少一种如本文所定义的分离的细菌和药学上可接受的赋形剂的治疗组合物，以及制备这种治疗组合物的方法。治疗组合物可用于治疗生态失调，特别是胃肠道的生态失调。生态失调可以是与肠细菌感染，炎性肠病，脓包皮炎，肠易激综合征，代谢性疾病，神经精神障碍，自身免疫性疾病，变应性疾病，癌症或肝性脑病相关的生态失调。

背景技术

典型的人肠道微生物群包含100-1000个细菌物种。个体之间存在广泛的组成多样性，使得每个个体的微生物群与指纹一样独特(Qin，Li等.2010；Nielsen，Almeida等.2014)。成年人的微生物群中的大多数细菌物种来自四个高水平的分类学分类或门，厚壁菌门(Firmicutes)，拟杆菌门(Bacteroidetes)，放线菌门(Actinobacteria)和变形菌门(Proteobacteria)。这些群体从出生到成年到老年都有丰度的变化，其反映环境影响的变化，例如初始分娩方式，饮食，侵入例如病原体感染等，以及许多情况下的抗生素使用((Dominguez-Bello，Costello等.2010，Koenig，Spor等.2011，Ottman，Smidt等.2012)。在成年期，肠道微生物群由厚壁菌门和拟杆菌门主导，两者都是严格的厌氧菌。

肠道微生物群在以下方面起着关键作用：消化人胃肠道难以获取的食物，例如将碳水化合物代谢成短链脂肪酸(Sekirov，Russell等.2010)，与免疫系统相互作用以维持体内平衡(Hooper，Littman等.2012)，促进肠道成熟(Hooper，Wong等.2001)和免疫系统的发育。肠道微生物群在抵抗病原体入侵方面也起着重要作用，称为“定植抗性”。这通过存在的共生物种的多样性和丰富性以及通过占据关键生态位和营养素的利用来发挥作用(Lawleyand Walker 2013；Britton and Young 2014)。如果微生物体内平衡例如通过使用抗生素受到干扰，则可能发生向生态失调的转变。

生态失调为病原体提供了建立自身并引起所述个体疾病的机会。关于单个牵连病原体例如艰难梭菌(Clostridium difficile)(Lawley等.2012；Britton and Young 2014；Buffie等.2015)进行了最好的研究，但是生态失调也与其他更复杂的多因素疾病有关，例如炎症性肠病(IBD)，脓包炎(Angeriman等.2014)，肠易激综合征(IBS)，肝性脑病(Bajaj2014；Bajaj等.2012)代谢性疾病(包括代谢综合征，营养不良和肥胖)，神经精神障碍，例如帕金森病和阿尔茨海默病，自身免疫性疾病，变应性疾病和癌症(Jostins，Ripke等.2012，Collins 2014，Hold，Smith等.2014，Perez Martinez，Bauerl等.2014，Scheperjans，Aho等.2015；Blanton等.2016，Xu等.2015)。

粪便微生物群移植(FMT)已成功解决艰难梭菌相关的生态失调(Petrof等.2013，van Nood等.2013)，并且特定细菌的施用也证明对此有效(Lawley等.2012，Buffie等.2015)。FMT在其他肠道疾病的治疗以及与肠道微生物群相关的肠外疾病(包括代谢性疾病，神经精神障碍，自身免疫性疾病，变应性疾病和肿瘤)的管理方面也显示出有希望的结果(Xu等.2015)。

近年来，在了解肠道微生物群在健康和疾病中的作用以及如何为宿主的利益进行操作方面取得了很大进展。迄今为止，我们的大多数理解都是通过独立于培养的研究得出的，即使用分子和基因组技术通过研究微生物群的组成成分以及它们在疾病期间如何变化。该过程允许鉴定可以解决疾病的潜在治疗候选物。然而，已经证明难以分离，纯化和获得这种候选治疗细菌。