[发明专利]一种用来评估艾滋病合并结核感染的生物标记物在审
| 申请号： | 201711183449.6 | 申请日： | 2017-11-23 |
| 公开（公告）号： | CN109825508A | 公开（公告）日： | 2019-05-31 |
| 发明（设计）人： | 赵方;王辉;刘映霞;何云;程林;唐娴 | 申请（专利权）人： | 深圳市第三人民医院 |
| 主分类号： | C12N15/12 | 分类号： | C12N15/12;C12N15/11 |
| 代理公司： | 深圳国新南方知识产权代理有限公司 44374 | 代理人： | 崔春 |
| 地址： | 518112 广东省深圳市龙岗区布*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 结核感染 艾滋病 合并 生物标记物 评估 生物工程技术领域 相对表达量 引物组合物 诊断和治疗 临床治疗 生物样品 人血液 试剂盒 可用 个性化 筛选 预警 疾病 | ||
1.一种生物标记物，其特征在于，所述的生物标记物包含CDKN1C基因。
2.根据权利要求1所述的生物标记物，其特征在于，所述的生物标记物还包含SOCS3基因；
任选的，所述的标记物还包含SFXN1基因。
3.一种生物标记物，其特征在于，所述的生物标记物为CDKN1C基因和/或SOCS3基因和/或SFXN1基因所表达的mRNA或者其编码的蛋白。
4.权利要求1-3中任一权利要求所述的生物标记物在制备检测艾滋病合并结核感染的产品中的应用。
5.一种产品，其特征在于，包括用于检测权利要求1或2中所述的生物标记物的表达量的实时定量PCR的试剂。
6.包括用于检测权利要求1中所述的生物标记物的表达量的实时定量PCR的试剂在制备评估艾滋病合并结核感染的产品上的用途。
7.一种引物组合物，其特征在于，包含扩增SFXN1基因的至少一对引物、扩增SOCS3基因的至少一对引物和扩增CDKN1C基因的至少一对引物中的一种或多种与扩增β-Actin内参基因的引物的组合；
任选的，所述的扩增SFXN1基因的引物包含SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列；
任选的，所述的扩增SOCS3基因的引物包含SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列；
任选的，所述的扩增CDKN1C基因的引物包含SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列；
任选的，所述的扩增β-Actin内参基因的引物包含SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列。
8.根据权利要求7所述的引物组合物在制备评估艾滋病合并结核感染的试剂盒上的用途。
9.一种试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒包含权利要求7所述的引物组合物；
任选的，所述的试剂盒还包含荧光定量PCR试剂；
任选的，所述的荧光定量PCR试剂来自Takara公司SYBR Premix Ex Taq II RR820试剂盒中的试剂；
任选的，所述的试剂盒还包含反转录试剂；
任选的，所述的反转录试剂来自Takara公司PrimeScriptTMII 1st strand cDNASynthesis Kit 6210A的试剂盒中的试剂；
任选的，所述的试剂盒还包含RNA提取试剂；
任选的，所述的RNA提取试剂为Trizol法提取试剂；
任选的，所述的试剂盒还包含PBMC分离试剂；
任选的，所述的PBMC分离试剂来自GE公司货号为#17-1440-03的Ficoll淋巴细胞分离液。
10.一种筛选艾滋病合并结核感染的生物样品的系统，其特征在于，所述的系统包含：
实时定量PCR扩增装置，所述实时定量PCR扩增装置中设置有SFXN1基因、SOCS3基因、CDKN1C基因和β-Actin内参基因的特异性引物，以便利用所述特异性引物，对生物样品中提取的核酸样本进行实时定量PCR扩增，分别得到SFXN1基因、SOCS3基因、CDKN1C基因和β-Actin内参基因的Ct值以及基于Ct值计算得到的2-ΔΔCt值；
判断装置，所述判断装置与所述实时定量PCR扩增模块相连，通过对SFXN1基因、SOCS3基因和CDKN1C基因的表达水平进行判断，用于筛选艾滋病合并结核感染的生物样品；
任选的，所述判断装置中用于筛选艾滋病合并结核感染的生物样品的判断基准为：生物样品中的SFXN1基因的mRNA表达量倍比值＞2.5和/或生物样品中的SOCS3基因的mRNA表达量倍比值＞3和/或CDKN1C基因的mRNA表达量倍比值＜0.2，其中生物样品中的SFXN1基因/SOCS3基因/CDKN1C基因的mRNA表达量倍比值＝(生物样品中的SFXN1基因/SOCS3基因/CDKN1C基因的m RNA相对表达量)/(对照样品中的SFXN1基因/SOCS3基因/CDKN1C基因的mRNA相对表达量)，生物样品中的SFXN1基因/SOCS3基因/CDKN1C基因的mRNA相对表达量＝(生物样品的SFXN1基因/SOCS3基因/CDKN1C基因的2-ΔΔCt)/生物样品的β-Actin内参基因的2-ΔΔCt；
任选的，所述的SFXN1基因特异性引物包含SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列；
任选的，所述的SOCS3基因特异性引物包含SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列；
任选的，所述的CDKN1C基因特异性引物包含SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列；
任选的，所述的β-Actin内参基因特异性引物包含SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列；
任选的，所述的系统还包含反转录扩增装置，用于将生物样品的RNA转化为cDNA，所述的反转录扩增装置与实时定量PCR扩增装置相连；
任选的，所述的系统还包含核酸提取装置，所述的核酸提取装置与所述的反转录扩增装置相连，用于提取所述生物样品中的核酸样本。
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