[发明专利]核酸文库的动力学排除扩增

权利要求书

1.一种用于扩增核酸的方法，所述方法包括

(a)提供扩增反应物，所述扩增反应物包括

(i)扩增位点的阵列，及

(ii)包括多个不同的靶核酸的溶液，

其中在所述溶液中所述不同的靶核酸的数量超过在所述阵列中扩增位点的数量，

其中所述不同的靶核酸具有流体通路至多个扩增位点，且

其中每个所述扩增位点包括容纳所述多个不同的靶核酸中的数个核酸的容量；及

(b)使所述扩增反应物反应以产生多个扩增位点，所述多个扩增位点各自包括来自所述溶液中的单个靶核酸的扩增子的克隆群，其中所述反应包括(i)从转运到每个所述扩增位点的单个靶核酸产生第一扩增子，及(ii)从转运到每个所述扩增位点的所述单个靶核酸或从所述第一扩增子产生后续的扩增子，其中在所述扩增位点产生所述后续的扩增子的平均速率超过在所述扩增位点产生所述第一扩增子的平均速率。

2.根据权利要求1所述的方法，其中每个所述扩增位点包括被用于在(b)中产生所述扩增子的多个引物。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述第一扩增子的所述产生包括将至少一个所述引物从非可延伸状态转化为可延伸状态。

4.根据权利要求2所述方法，其中所述扩增位点的阵列包括在表面上的特征的阵列。

5.根据权利要求4所述的方法，其中所述特征是非连续的且被缺乏被用于在(b)中产生所述扩增子的所述引物的所述表面的间隙区域间隔。

6.根据权利要求1所述的方法，其中所述反应包括与(i)所述第一扩增子的所述产生，及(ii)所述后续的扩增子的所述产生同时地，将靶核酸从所述溶液转运到所述扩增位点。

7.根据权利要求1所述的方法，其中在(i)所述第一扩增子的所述产生，及(ii)所述后续的扩增子的所述产生之前将所述靶核酸从所述溶液转运到所述扩增位点。

8.根据权利要求1所述的方法，其中每个所述扩增位点包括能够结合所述溶液中的所述不同的靶核酸的多个捕获剂。

9.根据权利要求8所述的方法，其中所述扩增位点的阵列包括在表面上的特征的阵列。

10.根据权利要求9所述的方法，其中每个所述特征的面积大于被转运至每个所述扩增位点的所述单个靶核酸的排除体积的平均直径。

11.根据权利要求10所述的方法，其中所述特征是非连续的且被缺乏所述捕获剂的所述表面的间隙区域间隔。

12.根据权利要求9所述的方法，其中每个所述特征包括珠、孔、通道、脊、突起、或其组合。

13.根据权利要求8所述的方法，其中所述捕获剂包括与所述不同的靶核酸互补的捕获核酸。

14.根据权利要求13所述的方法，其中所述不同的靶核酸包括与所述捕获核酸互补的通用序列。

15.根据权利要求8所述的方法，其中所述捕获剂包括与连接于所述不同的靶核酸的配体结合的受体。