[发明专利]一种一键化分析RNA数据的系统

权利要求书

1.一种一键化分析RNA数据的系统，其特征在于：该系统包括系统运行脚本模块，所述系统运行脚本模块包括作图模块、数据挖掘模块以及数据分析模块；

所述数据分析模块用于差异基因分析；

所述数据挖掘模块用于根据差异基因分析结果中的检验参数进行差异基因的显著性筛选；

所述作图模块用于将差异基因分析结果以及显著性筛选结果通过绘图进行显示。

2.根据权利要求1所述一种一键化分析RNA数据的系统，其特征在于：所述系统运行脚本模块采用shell语言和R语言编写。

3.根据权利要求1所述一种一键化分析RNA数据的系统，其特征在于：所述数据分析模块包括用于mRNA的差异基因分析子模块和用于lncRNA的差异基因分析子模块；用于mRNA的差异基因分析子模块通过调用相应分析程序对测序数据依次进行基因组比对、转录本组装和基因差异结果分析，得到差异基因分析结果；用于lncRNA的差异基因分析子模块通过调用相应分析程序对测序数据依次进行基因组比对、转录本组装、lncRNA筛选和基因差异结果分析，得到差异基因分析结果。

4.根据权利要求3所述一种一键化分析RNA数据的系统，其特征在于：所述比对的结果在进行所述组装之前，对该结果中的比对至参考基因组不同染色体上的测序片段按照染色体编号排序。

5.根据权利要求3所述一种一键化分析RNA数据的系统，其特征在于：所述检验参数选自p值或/和q值。

6.根据权利要求1所述一种一键化分析RNA数据的系统，其特征在于：所述系统还包括用于生成脚本操作路径的准备模块。

7.根据权利要求6所述一种一键化分析RNA数据的系统，其特征在于：所述操作路径包括用于存放参考基因组序列文件和基因注释文件的根路径以及位于该路径下的用于存放实验组和对照组的测序数据的子路径。

8.根据权利要求1所述一种一键化分析RNA数据的系统，其特征在于：所述系统运行于LINUX环境。