[发明专利]一种提取大型真菌基因组DNA的方法在审
申请号: | 201710235246.0 | 申请日: | 2017-04-12 |
公开(公告)号: | CN107974449A | 公开(公告)日: | 2018-05-01 |
发明(设计)人: | 李鹏;唐雪明;潘爱虎;蒋玮;王金斌;武国干;吕贝贝;吴潇;贾军伟;王荣谈;白蓝;刘华;王慧;叶吉妮 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 上海开祺知识产权代理有限公司31114 | 代理人: | 张晓敏,费开逵 |
地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 提取 大型 真菌 基因组 dna 方法 | ||
1.一种提取大型真菌基因组DNA的方法,包括以下步骤:
1)破碎细胞
将大型真菌的子实体或菌丝在液氮中研磨,研磨结束后加入试剂Ⅰ,震荡,水浴,离心,取上清液;
其中,所述的试剂I中各组分及含量为:Tris-HCl 100~400mM,NaCl 100~400mM,EDTA 10~40mM,SDS细胞裂解液0.3~0.6wt.%,乙烯聚吡咯烷酮0.1~1wt.%,pH=7.7~8.0;
2)去除蛋白质、抽提基因组DNA
向步骤1)的上清液中加入试剂Ⅱ,混匀,离心,取上清液;
其中,所述试剂Ⅱ中按体积比含有:苯酚:氯仿:异戊醇=25:20~24:1~2;
3)沉淀、溶解基因组DNA
加入异丙醇,混匀,离心,舍弃上清,保留沉淀,再加入试剂Ⅲ,混匀,然后加入试剂Ⅳ,溶解所提取的DNA,混匀;
其中,所述试剂Ⅲ为灭菌蒸馏水或1×TE缓冲液;试剂Ⅳ中含有:异硫氰酸胍6~10M,Tris-HCl 20~60mM,EDTA 30~60mM,聚乙二醇辛基苯基醚10~40mM;
4)纯化基因组DNA
将步骤3)的混合液移入核酸吸附柱中,静置,离心,提取物吸附至核酸吸附柱,弃滤液;向核酸纯化柱中加入试剂Ⅴ,离心,弃去滤液,再加试剂Ⅵ,离心,弃去滤液;
其中,所述的试剂Ⅴ包括异硫氰酸胍6~10M,Tris-HCl 20~60mM;试剂Ⅵ包括;Tris-HCl 20~60mM,NaCl 100~400mM,乙醇70~75vol%;
5)洗脱基因组DNA
将核酸纯化柱安置于离心管内,离心,向核酸纯化柱中加入试剂Ⅲ,静置,离心,获得所述大型真菌基因组DNA。
2.根据权利要求1所述提取大型真菌基因组DNA的方法,其特征在于,步骤1)中,破碎细胞时,水浴温度为60~65℃。
3.根据权利要求1所述提取大型真菌基因组DNA的方法,其特征在于,步骤1)中,所述试剂Ⅰ包括:Tris-HCl 200~300mM,NaCl 200~300mM,EDTA 20~30mM,SDS细胞裂解液0.4~0.5wt.%,乙烯聚吡咯烷酮0.4~0.6wt.%,pH=7.7~8.0。
4.根据权利要求1所述提取大型真菌基因组DNA的方法,其特征在于,步骤2)中,所述试剂Ⅱ中按体积比含有苯酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。
5.根据权利要求1所述提取大型真菌基因组DNA的方法,其特征在于,步骤3)中,所述试剂Ⅳ包括:异硫氰酸胍7~9M,Tris-HCl 30~50mM,EDTA 40~50mM,聚乙二醇辛基苯基醚20~30mM。
6.根据权利要求1~5任一项所述提取大型真菌基因组DNA的方法,其特征在于,步骤4)中,所述的核酸纯化柱是含有聚丙烯膜的核酸纯化柱,孔径为0.8~1.2μm。
7.根据权利要求1所述提取大型真菌基因组DNA的方法,其特征在于,步骤4)中,所述试剂Ⅴ包括:异硫氰酸胍7~9M,Tris-HCl 30~50mM;试剂Ⅵ包括:Tris-HCl 30~50mM,NaCl 200~300mM,乙醇70~75vol%。
8.根据权利要求1所述提取大型真菌基因组DNA的方法,其特征在于,步骤5)中,洗脱基因组DNA时,所述试剂Ⅲ的温度为60~65℃。
9.根据权利要求1~8任一项所述提取大型真菌基因组DNA的方法,其特征在于,所述真菌子实体的质量为100~200mg,真菌子实体和试剂I的质量体积比为1:5~6,mg/μl;或者真菌菌丝的质量为20~50mg,真菌菌丝和试剂I的质量体积比为1:30~40,mg/μl。
10.根据权利要求1~9任一项所述提取大型真菌基因组DNA的方法,其特征在于,所述试剂I、试剂II、异丙醇、试剂III、试剂IV、试剂V和试剂VI之间的体积比为1:1~1.5:0.3~0.5:0.1~0.2:0.5~1:0.1~0.2:0.1~0.2。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于上海市农业科学院,未经上海市农业科学院许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201710235246.0/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。