[发明专利]新型志贺菌噬菌体及其用途

说明书

本发明涉及对志贺菌物种的菌株具有特异性和裂解活性的分离的噬菌体，使用所述噬菌体及其子代和衍生物来控制志贺菌物种在各种环境中(例如，食品安全、卫生、调节微生物群、益生元、益生菌)的生长的方法。

技术领域

本发明涉及9种新型噬菌体：SHFML-26、SHFML-11、SHSML-45、SHSML-52-1、SHBML-50-1、SHBML-50-2、SHSML-52-2、SHSML-36和SHFML-21(“保藏的噬菌体”(DepositedBacteriophages))，和组合物及其相应的制剂，其有针对志贺菌属的菌株的裂解活性，包括但不限于痢疾志贺菌(S.dysenteriae)、福氏志贺菌(S.flexneri)、福氏志贺菌1、福氏志贺菌1a、福氏志贺菌1b、福氏志贺菌2、福氏志贺菌2a、福氏志贺菌2b、福氏志贺菌3、福氏志贺菌4、福氏志贺菌5、福氏志贺菌6、宋内氏志贺菌(S.sonnei)和鲍氏志贺菌(S.boydii)(“目标细菌”)。

背景技术

噬菌体

噬菌体是附着于其特定宿主并通过涉及复杂裂解周期的内部复制和细菌裂解来杀死它们的细菌病毒，所述复杂裂解周期涉及多个结构和调控基因。噬菌体是非常特殊的，因为它们只攻击其目标细菌的宿主。它们不能感染人类或其它真核细胞。在20世纪初Frederick Twort和Felix D'Herelle首次鉴定了噬菌体，他们将其称之为噬菌体或细菌食用者(希腊语吞噬(phago)意思是吃或吞食)。Duckworth(1976)Bacteriol Rev 40(4):793-802；Summers(1999)Bacteriophage discovered.Felix d'Herelle and the origins of molecular biology.New Haven,CT，耶鲁大学出版社：47-59。

裂解性和溶原性噬菌体

噬菌体具有裂解周期或溶原化周期，但几乎没有噬菌体能够两者都进行。使用裂解性噬菌体如T4噬菌体，在病毒体复制后立即破开(裂解)和破坏细菌细胞。一旦细胞被破坏，新的噬菌体病毒就可以找到新的宿主。Kutter和Sulakvelidze(2005)Bacteriophages：Biology and Application.CRC出版社：381-436。

与之相比，溶原化周期不会导致宿主细胞立即裂解。那些能够承受溶原化的噬菌体称为温和噬菌体。它们的病毒基因组将与宿主DNA整合，并与其适度无害地复制，或者甚至可以成为质粒。病毒保持休眠，直到宿主状况恶化(例如，由于营养物质的消耗)，然后内源噬菌体(称为前噬菌体)变得活跃。在这一点上，它们引发繁殖周期，导致宿主细胞裂解。由于溶原化周期允许宿主细胞继续存活和繁殖，所以病毒在所有宿主细胞的子代中繁殖。参见Kutter和Sulakvelidze(2005)Bacteriophages：Biology and Application。

噬菌体结构