[发明专利]普通小麦TaCHS7BL5’UTR区的微型反向重复转座子TaMITE81基因及其应用在审
申请号: | 201610229580.0 | 申请日: | 2016-04-14 |
公开(公告)号: | CN105755004A | 公开(公告)日: | 2016-07-13 |
发明(设计)人: | 刘宝龙;张怀刚;席杏媛;刘登才;张波;陈文杰;沈裕虎;魏乐;李建民 | 申请(专利权)人: | 中国科学院西北高原生物研究所 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/82;A01H5/00 |
代理公司: | 兰州中科华西专利代理有限公司 62002 | 代理人: | 李艳华 |
地址: | 810001 *** | 国省代码: | 青海;63 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 普通 小麦 tachs7bl5 utr 微型 反向 复转 座子 tamite81 基因 及其 应用 | ||
技术领域
本发明涉及植物基因工程领域,尤其涉及普通小麦TaCHS7BL5’UTR区的微型反向重复转座子TaMITE81基因及其应用。
背景技术
MITEs是一组各异的短而非自主性的DNA元件,被认为是自主的DNA转座子缺失(PetersenG,SebergO(2000)PhylogeneticevidenceforexcisionofStowawayminiatureinverted-repeattransposableelementsinTriticeae(Poaceae).MolBiolEvol17:1589-1596)。MITEs片段较短,通常只有60~700bp,没有编码能力。它们有保守的短的末端反向重复序列(TIRs),通常形成一个发夹一样的二级结构,并且具有靶位点的偏好。MITEs扩增并插入DNA序列的机制使得该元件两端是重复的靶位点(TSDs),并且该元件本身的末端反向重复序列(TIRs)长短不一,一般会富含“AT”(IzsvakZ,IvicsZ,ShimodaN,MohnD,OkamotoH,HackettPB(1999)Shortinverted-repeattransposableelementsinteleostfishandimplicationsforamechanismoftheiramplification.JMolEvol48:13-21)。
MITEs缺失蛋白编码区但保留了他们祖先的一些序列特征(TSDs和TIRs),从而进行分类(FeschotteC,MouchesC(2000)Recentamplificationofminiatureinverted-repeattransposableelementsinthevectormosquitoCulexpipiens:characterizationoftheMimofamily.Gene250:109-116)。最初,两组MITEs根据它们TSDs结构特点来区分:“Stowaway”MITETSDs结构由“TA”组成,“Tourist”MITE由“TAA”组成(JiangN,BaoZR,ZhangXY,HirochikaH,EddySR,McCouchSR,WesslerSR(2003)AnactiveDNAtransposonfamilyinrice.Nature421:163-167)。最近研究表明,MITEs来源于其它DNA转座家族的片段缺失,包括:hAT,CACTA,Mutator和PiggyBac转座子,已经在很多物种中证实(BenjakA,BoueS,ForneckA,CasacubertaJM(2009)RecentamplificationandimpactofMTTEsonthegenomeofgrapevine(VitisviniferaL.).GenomeBiologyandEvolution1:75-84;KuangHH,PadmanabhanC,LiF,KameiA,BhaskarPB,ShuOY,JiangJM,BuellCR,BakerB(2009)Identificationofminiatureinverted-repeattransposableelements(MTTEs)andbiogenesisoftheirsiRNAsintheSolanaceae:NewfunctionalimplicationsforMTTEs.GenmomeRes19:42-56;MenzelG,DechyevaD,KellerH,LangeC,HimmelbauerH,SchmidtT(2006)Mobilizationandevolutionaryhistoryofminiatureinverted-repeattransposableelements(MTTEs)inBetavulgarisL.ChromosomeRes14:831-844)。活性DNA转座子的衍生物缺乏使得它们转移和整合的必要转移酶,MITEs的移动可能取决于自主性转座子(IzsvakZ,IvicsZ,ShimodaN,MohnD,OkamotoH,HackettPB(1999)Shortinverted-repeattransposableelementsinteleostfishandimplicationsforamechanismoftheiramplification.JMolEvol48:13-21)。
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