[发明专利]靶向的RNA编辑有效
申请号: | 201580069286.1 | 申请日: | 2015-12-17 |
公开(公告)号: | CN107109413B | 公开(公告)日: | 2021-03-09 |
发明(设计)人: | B·克莱恩;G·J·普拉滕伯格 | 申请(专利权)人: | ProQR治疗上市公司Ⅱ |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113 |
代理公司: | 北京尚诚知识产权代理有限公司 11322 | 代理人: | 龙淳;周琴 |
地址: | 荷兰*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 靶向 rna 编辑 | ||
1.一种用于在真核细胞中定点编辑靶RNA序列中的腺苷核苷酸的寡核苷酸构建体,所述寡核苷酸构建体包含:
(a)靶向部分,其包含与靶RNA的一部分互补的反义序列;和
(b)募集部分,其能够形成分子内茎环结构;能够结合和募集天然存在于所述细胞中的RNA编辑实体;并能够进行所述腺苷核苷酸的编辑,其中:
所述靶向部分在与所述靶RNA中待编辑的所述腺苷核苷酸相对的位置包含非互补核苷酸且其中所述非互补核苷酸是胞苷,
其中所述编辑实体包含hADAR1或hADAR2。
2.根据权利要求1所述的寡核苷酸构建体,其中所述募集部分不与靶RNA互补。
3.根据权利要求1或2所述的寡核苷酸构建体,其中所述募集部分包含序列(RY或YR)nNm(RY或YR)n,其中R是腺苷或鸟苷,Y是尿苷或胞苷,N是腺苷、鸟苷、胞苷、尿苷或肌苷,n为3或更大,m为4或更大,并且其中N形成环且两个(RY)n或(YR)n序列通过互补碱基配对形成双链茎结构。
4.根据权利要求1或2所述的寡核苷酸构建体,其中所述募集部分包含具有以下序列的五核苷酸:GCUMA,其中G是鸟苷,C是胞苷,M是腺苷或胞苷,并且U是尿苷。
5.根据权利要求4所述的寡核苷酸构建体,其中所述募集部分包含具有以下序列的五核苷酸:GCUAA。
6.根据权利要求4所述的寡核苷酸构建体,其中所述募集部分包含选自SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:24的序列。
7.根据权利要求4所述的寡核苷酸构建体,其中dsRNA茎环结构衍生自或模拟编码人GluR蛋白的B结构域的RNA序列。
8.根据权利要求1所述的寡核苷酸构建体,其中所述募集部分包含核苷酸序列:
5’-(AUANa)nUAUAACAAUAUgcuaaAUGUUGUUAUA(NbUAU)n-3’
其中Na和Nb各自是可以为A、G、C或U的单个核苷酸,条件是在形成茎环结构时Na和Nb形成错配碱基对,并且n为1或0。
9.根据权利要求1所述的寡核苷酸构建体,其中所述募集部分包括包含序列(CG)3T4(CG)3(SEQ ID NO:5)的脱氧寡核苷酸序列,其中C是胞苷,G是鸟苷,并且T是胸苷。
10.根据权利要求1或2所述的寡核苷酸构建体,其中所述核苷酸中的一个或多个包含化学修饰。
11.根据权利要求10所述的寡核苷酸构建体,其中与所述靶RNA序列中并非编辑靶标的腺苷相对的所有尿苷是2’-甲氧基-(2’-OMe)尿苷。
12.根据权利要求1或2所述的寡核苷酸构建体,其中寡核苷酸的长度为20至100个核苷酸之间。
13.根据权利要求1或2所述的寡核苷酸构建体,其中寡核苷酸的长度为24至60个核苷酸之间。
14.根据权利要求1或2所述的寡核苷酸构建体,其中寡核苷酸的长度为30至50个核苷酸之间。
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