[发明专利]重组核酸片段RecCR033207及其检测方法

说明书

本申请提供了重组核酸片段及其检测方法。本申请还提供了含有重组核酸片段的水稻植株的选育方法，利用分子标记对重组植株进行前景选择和背景选择，获得了含有重组核酸片段的水稻植株。

技术领域

本申请涉及全基因组选择育种技术。具体而言，本申请涉及利用全基因组选择育种技术选育含有重组核酸片段的水稻植株，以及由此而获得的重组核酸片段及其检测方法。

背景技术

长期以来，传统育种的选择方法主要依赖于田间表现型的评价，根据育种家个人经验进行取舍，其最大的缺点在于耗时长，效率较低。要提高选择的效率，最理想的方法应是能够直接对基因型进行选择。随着分子生物技术的发展，分子标记为实现对基因型的直接选择提供了可能。近年来，已开始应用分子标记辅助选择方法来改良个别目标性状，能够显著的缩短育种年限。

三系杂交水稻具有稳产、高产等优势，是在细胞质雄性不育(即CMS，CytoplasmicMale Sterility)基础上开发配套的恢复系、保持系和不育系。CMS恢复系主要有野败型(WA)CMS恢复系和红莲型(HL)CMS恢复系，以及粳稻包台型(BT)CMS恢复系(万建民等，2008)。上述3种类型中控制着育性恢复的关键位点之一就是Rf-1基因及其相邻区间，它包括了野败型CMS恢复基因Rf4(Tang等，2014)、包台型CMS恢复基因Rf-1(Rf1a)和Rf1b(Wang等，2006；Komori等，2004)、红莲型CMS恢复基因Rf5(Rf1a)(Hu等，2012)。

发明内容

一方面，本申请提供了重组核酸片段，其选自：i)包含SEQ ID NO:1所示序列224-367位核苷酸的序列或其片段或其变体或其互补序列；ii)包含SEQ ID NO:1所示序列的序列或其片段或其变体或其互补序列；iii)包含SEQ ID NO:2所示序列339-607位核苷酸的序列或其片段或其变体或其互补序列；iv)包含SEQ ID NO:2所示序列的序列或其片段或其变体或其互补序列；以及以上片段的组合。在一实施方案中，所述重组核酸片段为基因组重组核酸片段。