[发明专利]一种用于海洋生物蛋白组学研究样品的制备处理方法有效
| 申请号: | 201510951996.9 | 申请日: | 2015-12-18 |
| 公开(公告)号: | CN105352778B | 公开(公告)日: | 2018-07-20 |
| 发明(设计)人: | 杨劲峰;吴文惠;陈山乔 | 申请(专利权)人: | 荣成广润水产食品有限公司 |
| 主分类号: | G01N1/28 | 分类号: | G01N1/28 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 264309 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 海洋生物 蛋白组 研究 样品 制备 处理 方法 | ||
1.一种用于海洋生物蛋白组学研究样品的制备处理方法,其特征在于:其经过下列工艺步骤:
(1)样品预处理:取海洋生物于离心管中,加入裂解液,料液比1︰2~5m/v,加入蛋白酶抑制剂使其终浓度为0.5~1.2mM,用组织匀浆器充分打散后,离心,取上清液和沉淀物,上清液即为组织可溶性蛋白溶液;
(2)膜蛋白提取:将步骤(1)中得到的沉淀物采用Tris-Hcl缓冲液重悬,重悬液进行低温破碎,离心,收集上清液,得到组织细胞膜蛋白的提取液;
(3)丙酮沉淀:将步骤(1)、步骤(2)中得到的上清液合并,然后在合并的上清液中加入其体积4~6倍的预冷丙酮溶液,震荡混合,-20℃条件下沉淀2~4h,离心,收集沉淀;
(4)二次丙酮沉淀:将步骤(3)中得到的沉淀中加入其体积3~5倍的预冷丙酮溶液,震荡混合,-20℃条件下沉淀1~2h,离心,收集沉淀;按上述步骤重复操作1~2次;合并沉淀;
(5)总蛋白提取:将步骤(4)中得到的合并后的沉淀在常温下干燥后,溶解于裂解液中,料液比1︰2~5m/v,室温作用2~4h;离心,取上清液;上清液再次离心,弃沉淀,取上清液;合并上清液,即得组织的总蛋白溶液;
(6)还原、烷基化:定量称取步骤(5)中得到的总蛋白溶液作为样品,加入其体积3~4倍的50mmol/L的NH4HCO3溶液,然后加入0.5mol/L 的DTT至终浓度为3~4mmol/L,室温孵育30~50min;然后再加入0.5mol/L 碘乙酰胺至终浓度为55~90mmol/L,室温避光孵育20~50min;再用50mmol/L的NH4HCO3冲洗1~3次,乙腈脱水,冻干,保存,得海洋生物蛋白组学样品。
2.根据权利要求1所述的一种用于海洋生物蛋白组学研究样品的制备处理方法,其特征在于:所述的步骤(1)中的海洋生物为马尾藻、裙带菜或紫菜。
3.根据权利要求1所述的一种用于海洋生物蛋白组学研究样品的制备处理方法,其特征在于:所述的步骤(1)、步骤(5)中的裂解液的配方为:50mM Tris-HCl pH7.4、150mMNaCl、1%NP-40和0.1%SDS混合制成或为市售裂解液RLT Buffer。
4.根据权利要求1所述的一种用于海洋生物蛋白组学研究样品的制备处理方法,其特征在于:所述的步骤(1)中的蛋白酶抑制剂为PMSF或Cocktail。
5.根据权利要求1所述的一种用于海洋生物蛋白组学研究样品的制备处理方法,其特征在于:所述的步骤(2)中的Tris-Hcl缓冲液的配方为:50mM Tris-HCL、1mM EGTA和1mMPMSF混合制成,调节pH值为7.4。
6.根据权利要求1所述的一种用于海洋生物蛋白组学研究样品的制备处理方法,其特征在于:所述的步骤(2)中的低温破碎为液氮研磨破碎或置于冰盒上,超声破碎。
7.根据权利要求6所述的一种用于海洋生物蛋白组学研究样品的制备处理方法,其特征在于:所述的超声破碎是控制超声破碎仪功率50~100w,超声0.8s,关闭0.8s,超声破碎时间1~5min。
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