[发明专利]一组用于肿瘤分子分型的基因及其应用

说明书

本发明公开了一组用于肿瘤分子分型的基因，包括ACPP基因、AGR2基因等38个基因。此外，本发明还公开了一种用于肿瘤分子分型的试剂盒及应用。本发明有助于识别肿瘤的组织来源，在获得肿瘤样本后，可通过对上述基因组的检测和联合分析，客观准确地判别该肿瘤样本的组织起源和癌症类型，从而对患者进行有针对性的治疗。

技术领域

本发明涉及癌症诊断和分子生物学领域，以及诊断技术在临床上的应用。具体地，本发明涉及一组用于肿瘤分子分型的基因及其应用。本发明还涉及一种用于肿瘤分子分型的试剂盒。

背景技术

肿瘤是威胁人类健康的重要疾病之一。根据《2012中国肿瘤登记年报》，全国每6分钟就有一人被确诊为癌症，每天有8550人确诊为癌症，每七到八人中就有一人死于癌症。我国恶性肿瘤的发病及死亡呈上升趋势，每年新发癌症病例约350万，癌症特异性死亡约250万。预计到2020年，中国每年的癌症死亡总数将达到300万左右，患病总数达600万。

目前，癌症的诊断主要包括详细的病史询问，全面的体格检查，影像学检查(包括X线常规透视、拍片、各种造影、各种体层检查；CT、ECT、核磁共振检查；B型超声检查，核医学检查等)，病理学检查，内窥镜检查，放射免疫学检查等。肿瘤的影像诊断虽有了很大的发展，但是目前最先进的医学技术也只能“捕捉”到直径0.5厘米以上的肿块，体积较小时传统影像方法则束手无策。病理学诊断是肿瘤诊断的“金标准”和临床治疗的基础，但病理诊断也有局限性。病理学检查的结果大大依赖于病理医生的专业技术水平。因此，需要一种比较客观的判断肿瘤类型和组织来源的方法。

肿瘤是一类分子水平上高度异质性的疾病。组织学形态相同的肿瘤，其分子遗传学改变不尽一致，从而导致了肿瘤治疗反应和预后的差别。近年来，随着科学技术的发展，手术治疗、化学治疗、放射治疗等传统治疗手段不断发展，生物靶向治疗药物不断研发，为了达到最大疗效和最小毒性，肿瘤类型的诊断和精确分型是关键。因此对肿瘤进行分子分型是肿瘤个体化治疗的必然要求。

在世界范围内，大约3％-5％的癌症是原发灶不明转移性癌(Carcinomas ofunknown primary,CUP)，是一类病理学确诊为转移性恶性，但是经过详细评估仍不能确定原发位点的异质性肿瘤。目前临床上，尽管经过详细的影像学检查和免疫组化分析，但是还是只有大概20％-30％的原发灶不明转移癌能够找到原发灶。因此，如何准确识别原发灶不明转移癌的组织起源是目前肿瘤临床诊断中存在的痛点和难点。

基因分子诊断具有灵敏度高、特异性强、背景机理明确的优点，近年来被越来越多地运用于肿瘤检测。例如乳腺癌HER-2基因的扩增检测，肺癌、结直肠癌EGFR和K-RAS基因突变检测，腹腔胃肠道间质瘤C-kit基因检测等。但基本都是采用少数几个肿瘤标志物，只能用于单一肿瘤的亚型分类。而且，这些肿瘤标志物的研究往往是基于一定量的实验数据，所涉及的癌症种类和样本量都相对有限。近年来，随着基因组学不断发展，肿瘤基因大数据不断增加。因此，利用大数据分析方法，找到一种适用范围广、准确率高的识别肿瘤类型和组织来源的基因诊断方法，有助于实现个性化用药，对患者进行精准治疗具有重要的临床意义。

发明内容

本发明要解决的技术问题之一是提供一组用于肿瘤分子分型的基因，建立肿瘤分类模型，能够识别多种肿瘤的组织来源和肿瘤类型，有助于实现个体化治疗。

本发明要解决的技术问题之二是提供一组用于肿瘤分子分型的基因的用途。

本发明要解决的技术问题之三是提供一种用于肿瘤分子分型的试剂盒及其用途。

本发明要解决的技术问题之四是提供一组用于肿瘤分子分型的基因在制备用于肿瘤分子分型的基因芯片中的应用。

为解决上述技术问题，本发明采用如下技术方案：