[发明专利]一种免疫组库数据分析方法及终端有效

专利信息
申请号: 201510363037.5 申请日: 2015-06-26
公开(公告)号: CN105095687B 公开(公告)日: 2018-10-26
发明(设计)人: 贺建奎;童寅 申请(专利权)人: 南方科技大学
主分类号: G06F19/22 分类号: G06F19/22
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 郝传鑫;熊永强
地址: 518000 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 免疫 数据 分析 方法 终端
【说明书】:

发明实施例公开了一种免疫组库数据分析方法及终端,其中方法包括:接收针对第一样本的第一分析指令,该第一分析指令携带该第一样本的注释文件;响应该第一分析指令,根据该第一样本的注释文件,生成并输出针对该第一样本的整体分析图,该整体分析图包括V基因频率分布图、D基因频率分布图、J基因频率分布图、高克隆CDR3序列的频率分布图、CDR3的长度分布图、免疫多样性分析图、VDJ基因组合分析图、Ig链类型比例分布图和多Ig链类型共同序列分析图中的任意一种或多种分析图。可见,实施本发明实施例有利于对免疫组库的状况进行更全面的评估。

技术领域

本发明涉及计算机技术领域,尤其涉及一种免疫组库数据分析方法及终端。

背景技术

免疫组库包括个体内的所有特异性不同的T淋巴细胞和B淋巴细胞克隆总和。T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)是特异性识别抗原和介导免疫应答的分子,TCR/BCR的多样性直接反应了机体免疫应答的状态。免疫组库在疫苗和医药的发展、生物标志物的发现、最小残余疾病检测、自身免疫性疾病的研究以及移植后监测等都具有应用价值。在实际应用中,现有的一些平台在对免疫组库数据进行处理时,只能对免疫组库数据做简单序列的识别,不能对免疫组库数据进行更进一步的分析(例如,不能进行V、D和J基因频率分布分析,免疫多样性分析,高克隆CDR3(即互补决定区3)序列频率检验,CDR3长度分布分析,V、D和J基因组合分析,Ig链类型的比例分析和多Ig链类型共同序列分析等),从而不能使用户全面评估免疫组库的状况,深入挖掘免疫组库与疾病的关系。

发明内容

本发明实施例公开了一种免疫组库数据分析方法及终端,有利于对免疫组库的状况进行更全面的评估。

本发明实施例公开了一种免疫组库数据分析方法,所述方法包括:

接收针对第一样本的第一分析指令,所述第一分析指令携带所述第一样本的注释文件,所述注释文件包括所述第一样本的免疫组库数据的V基因种类、D基因种类、J基因种类、CDR3序列和Ig链的类型,所述第一样本的免疫组库数据包括多个TCR基因序列和/或多个BCR基因序列;

响应所述第一分析指令,根据所述第一样本的注释文件,生成并输出针对所述第一样本的整体分析图,所述整体分析图包括V基因频率分布图、D基因频率分布图、J基因频率分布图、高克隆CDR3序列的频率分布图、CDR3的长度分布图、免疫多样性分析图、VDJ基因组合分析图、Ig链类型比例分布图和多Ig链类型共同序列分析图中的任意一种或多种分析图。

本发明实施例还公开了一种终端,所述终端包括:

接收模块,用于接收针对第一样本的第一分析指令,所述第一分析指令携带所述第一样本的注释文件,所述注释文件包括所述第一样本的免疫组库数据的V基因种类、D基因种类、J基因种类、CDR3序列和Ig链的类型,所述第一样本的免疫组库数据包括多个TCR基因序列和/或多个BCR基因序列;

输出模块,用于响应所述第一分析指令,根据所述第一样本的注释文件,生成并输出针对所述第一样本的整体分析图,所述整体分析图包括V基因频率分布图、D基因频率分布图、J基因频率分布图、高克隆CDR3序列的频率分布图、CDR3的长度分布图、免疫多样性分析图、VDJ基因组合分析图、Ig链类型比例分布图和多Ig链类型共同序列分析图中的任意一种或多种分析图。

在本发明实施例中,终端将接收针对第一样本的第一分析指令,该第一分析指令携带第一样本的注释文件;终端将响应第一分析指令,根据第一样本的注释文件,生成并输出针对第一样本的整体分析图,该整体分析图包括V基因频率分布图、D基因频率分布图、J基因频率分布图、高克隆CDR3序列的频率分布图、CDR3的长度分布图、免疫多样性分析图、VDJ基因组合分析图、Ig链类型比例分布图和多Ig链类型共同序列分析图中的任意一种或多种分析图。可见,实施本发明实施例有利于对免疫组库的状况进行更全面的评估。

附图说明

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