[发明专利]一种混合蛋白酶体系、包含该混合蛋白酶体系的试剂盒及其使用方法在审
| 申请号: | 201510041720.7 | 申请日: | 2015-01-28 |
| 公开(公告)号: | CN104630178A | 公开(公告)日: | 2015-05-20 |
| 发明(设计)人: | 王德明 | 申请(专利权)人: | 苏州神洲基因有限公司 |
| 主分类号: | C12N9/22 | 分类号: | C12N9/22;C12N9/12;C12N15/66 |
| 代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 巩克栋;杨晞 |
| 地址: | 215600 江苏省苏州市张家港*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 混合 蛋白酶 体系 包含 试剂盒 及其 使用方法 | ||
1.一种用于基因克隆与组装的混合蛋白酶体系,其特征在于,所述混合蛋白酶体系在40-70℃高温下保持活性。
2.如权利要求1所述的混合蛋白酶体系,其特征在于,所述混合蛋白酶体系包含嗜热性增殖细胞核抗原(Proliferating Cell Nuclear Antigen,PCNA);
优选地,所述嗜热性增殖细胞核抗原为来源于激烈热球菌的增殖细胞核抗原(Pfu-PCNA)或超嗜热菌的增殖细胞核抗原(KOD-PCNA)中的任意一种或两种的混合物。
3.如权利要求2所述的混合蛋白酶体系,其特征在于,所述混合蛋白酶体系还包含核酸外切酶、嗜热性单链DNA结合蛋白或嗜热性DNA聚合酶中的任意一种或至少两种的混合物。
4.如权利要求3所述的混合蛋白酶体系,其特征在于,所述核酸外切酶为λ噬菌体核酸外切酶、T5噬菌体核酸外切酶、T7噬菌体核酸外切酶、大肠杆菌核酸外切酶I、大肠杆菌核酸外切酶III、大肠杆菌核酸外切酶VII、Redα或RecE中的任意一种或至少两种的混合物;
优选地,所述嗜热性单链DNA结合蛋白为来源于嗜热型栖热菌(Thermus thermophilus)的单链DNA结合蛋白、来源于水生型栖热菌(Thermus aquaticus)的单链DNA结合蛋白或来源于激烈热球菌(Pyrococcus furious)的单链DNA结合蛋白中的任意一种或至少两种的混合物;
优选地,所述嗜热性DNA聚合酶为经改良后的保真性高的Taq DNA聚合酶、Pyrobest DNA聚合酶、Pfu DNA聚合酶、KOD DNA聚合酶、Deep Vent DNA聚合酶、Vent DNA聚合酶或Pwo DNA聚合酶中的任意一种或至少两种的混合物。
5.一种含有如权利要求1-4任一项所述混合蛋白酶体系的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括反应缓冲液;反应缓冲液包含缓冲剂、盐和dNTP,可以包含:Tris、MgCl2、EDTA、甘油、牛血清白蛋白、dNTP、PEG和二硫苏糖醇;优选地,所述反应缓冲液包含:20-150mM的Tris-HCl,pH 7.0-8.0、1-6mM的MgCl2、0.1-1mM的EDTA、1-5%的甘油、10-50mg/mL的牛血清白蛋白(BSA)、0.1-0.3mM的dNTP、1-5%PEG、0.1-1mM的二硫苏糖醇(DTT)。
6.一种基因克隆与组装的方法,其特征在于,其包括如权利要求1-4所述包含该蛋白酶体系和反应缓冲液的试剂盒,使目标PCR产物参与同源重组反应,从而将其融入所需的载体中,由此得到在载体中特异性地插入有目标PCR产物的重组DNA分子。
7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,利用该蛋白酶体系和反应缓冲液介导的体外同源重组反应对目标DNA片段进行快速克隆,具体操作步骤为:先通过在PCR扩增引物5’端引入附加序列使得目标DNA两末端与载体DNA两末端分别带有至少15bp的同源序列,然后目标DNA与线性化的载体DNA在40-70℃高温下经该蛋白酶体系和反应缓冲液的催化形成重组中间体,最后该中间体直接转化到感受态细胞即可完成目标DNA至载体DNA的克隆过程;
优选地,所述方法包括以下步骤:
(1)线性化载体的制备:采用酶切法或PCR法获得线性化载体;所述酶切法为单酶切或双酶切,优选为双酶切;所述PCR法为采用高保真的DNA聚合酶扩增载体;优选地,对获得的线性化载体进行割胶纯化;
(2)目标片段的PCR扩增:用于目标DNA的PCR扩增的正向引物5’端需添加至少15bp与载体DNA 5’端同源序列,即其5’端反义链末端最后15bp碱基序列;用于目标DNA PCR扩增的反向引物5’端需添加至少15bp与载体DNA3’端同源序列,即其3’端正义链末端最后15bp碱基序列。
(3)同源重组并进行转化:采用如权利要求5所述试剂盒,将目标片段和线性化载体加到含有如权利要求1-5任一项所述混合蛋白酶体系和反应缓冲液的试管中在40-70℃高温下进行重组反应,实现在载体中特异性地插入目标片段,然后将得到的重组DNA分子进行转化到感应态细胞中;优选地,步骤(3)所述同源重组中,目标片段和线性化载体的摩尔比为1:1、2:1、3:1、4:1、5:1、6:1、7:1、8:1、9:1、10:1,优选为2:1、3:1;优选地,所述载体的用量为10-200ng优选地,所述同源重组的反应时间为20-60分钟,优选为30分钟。优选地,所述同源重组的反应温度为40-70℃,优选为45-60℃。
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