[发明专利]用于核酸特异性杂化合物的模板化装配的方法和组合物在审

专利信息
申请号: 201480038772.2 申请日: 2014-06-04
公开(公告)号: CN105358691A 公开(公告)日: 2016-02-24
发明(设计)人: 伊恩·邓恩;马修·劳勒 申请(专利权)人: 特里比奥迪卡有限责任公司
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11
代理公司: 北京德恒律治知识产权代理有限公司 11409 代理人: 章社杲;李伟
地址: 美国威*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 用于 核酸 特异性 化合物 模板 化装 方法 组合
【权利要求书】:

1.一种靶向模板化装配反应物,其包含:

a)结合靶核酸序列的至少一个核酸识别部分;

b)至少一个效应物局部部分;和

c)至少一个选择性反应性部分;其中所述反应物能够结合相应的模板化装配反应物而产生活性效应物结构。

2.根据权利要求1所述的反应物,其中所述核酸识别部分是核酸结合寡聚物。

3.根据权利要求1所述的反应物,其中所述核酸识别部分是与所述靶核酸序列杂交的核酸寡聚物。

4.根据权利要求1所述的反应物,其中所述选择性反应性部分是生物惰性的。

5.根据权利要求1所述的反应物,其中所述选择性反应性部分连接至所述核酸识别部分。

6.根据权利要求1所述的反应物,其中所述选择性反应性部分是生物正交反应性分子。

7.根据权利要求1所述的反应物,其中所述活性效应物结构调节酶活性、基因/蛋白质表达、分子信号传导和分子相互作用中的至少一个。

8.根据权利要求1所述的反应物,其中所述活性效应物结构相较于所述效应物局部部分的活性具有靶向活性。

9.根据权利要求1所述的反应物,其进一步包含化学连接子,所述化学连接子位于所述核酸识别部分与所述选择性反应性部分以及所述选择性反应性部分与所述效应物局部部分中的任一者之间。

10.根据权利要求9所述的反应物,其中所述化学连接子改善所述靶向模板化装配反应物的溶解度、疏水性、电荷、细胞渗透性、毒性、生物分布和稳定性中的至少一个。

11.根据权利要求9所述的反应物,其中所述化学连接子为柔性部分、裂解位点和化学修饰位点中的至少一个。

12.根据权利要求1所述的反应物,其中所述靶核酸序列选自癌症特异性核酸序列、病毒核酸序列、微生物特异性核酸序列、差异表达基因、疾病特异性核酸序列和其片段、部分或核酸基因产物。

13.一种靶向模板化装配反应物,其包含:

a)至少一个核酸识别部分;

b)至少一个生物正交部分;和

c)至少一个效应物局部部分。

14.根据权利要求13所述的反应物,其中所述核酸识别部分为选自由以下组成的组的寡聚物:DNA核苷酸、RNA核苷酸、经硫代磷酸酯修饰的核苷酸、2-O-烷基化RNA核苷酸、卤代核苷酸、锁核酸核苷酸(LNA)、肽核酸(PNA)、吗啉代核酸类似物、假尿苷核苷酸、黄嘌呤核苷酸、次黄嘌呤核苷酸、2-脱氧肌苷核苷酸、能够形成碱基对的其它核酸类似物和其组合。

15.根据权利要求13所述的反应物,其中所述核酸识别部分结合选自由以下所组成的组的靶核酸序列:致癌基因、突变基因、致癌病毒基因、病毒核酸序列、微生物核酸序列、差异表达基因及其片段、部分或核酸基因产物。

16.根据权利要求13所述的反应物,其中所述生物正交部分选自由以下所组成的组:叠氮化物、环辛炔、硝酮、降冰片烯、氧杂降冰片二烯、膦、二烷基膦、三烷基膦、膦基硫醇、膦基苯酚、环辛烯、氧化腈、硫酯、四嗪、异腈、四唑、四环烷和其衍生物。

17.根据权利要求13所述的反应物,其中所述效应物局部部分选自由以下所组成的组:肽、拟肽结构的非活性部分、药物的非活性部分和其它生物活性化合物。

18.根据权利要求13所述的反应物,其中所述效应物局部部分小于20kDa。

19.根据权利要求13所述的反应物,其中所述核酸识别部分、所述生物正交部分和所述效应物局部部分中的一个或多个被化学连接子官能化。

20.根据权利要求13所述的反应物,其进一步包含化学连接子,所述化学连接子位于所述核酸识别部分与所述生物正交部分以及所述生物正交部分与所述效应物局部部分中的任一者之间。

21.根据权利要求20所述的反应物,其中所述化学连接子选自由以下所组成的组:烷基、烯基、酰胺、酯、硫酯、酮、醚、硫醚、二硫化物、乙二醇、环烷基、苄基、杂环基、马来酰亚胺基、腙、尿烷、唑类、亚胺、卤代烷基、氨基甲酸酯和其组合。

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