[发明专利]靶向IFNAR2基因的RNA干扰表达载体构建及应用有效
申请号: | 201410203742.4 | 申请日: | 2014-05-14 |
公开(公告)号: | CN103952413A | 公开(公告)日: | 2014-07-30 |
发明(设计)人: | 张建峰;沈海燕;张春红;郭鹏举;陈琴苓;卢宇 | 申请(专利权)人: | 广东省农业科学院动物卫生研究所;江苏省农业科学院 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/85;C12N15/64 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 苏运贞;裘晖 |
地址: | 510000 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 靶向 ifnar2 基因 rna 干扰 表达 载体 构建 应用 | ||
技术领域
本发明属于分子生物学领域,特别涉及靶向IFNAR2基因的RNA干扰表达载体构建及应用。
背景技术
干扰素的抗病毒作用是干扰素分子结合到干扰素受体之后,向细胞核传播信号,2,5-腺苷酸合成酶和蛋白激酶被活化,最后阻断病毒蛋白的翻译和病毒RNA的合成。干扰素受体是干扰素连锁反应的初始蛋白。人的干扰素受体分Ⅰ型干扰素受体(该受体与干扰素α、β结合)及Ⅱ型干扰素受体(与干扰素γ结合产生特异的敏感性)。此外,已证实Ⅱ型干扰素受体对干扰素α、β也有一定的敏感性,干扰素α亚型和β亚型均对干扰素受体敏感。
IFN生物效应的发挥,需要跟相应的信号受体结合。根据IFN的分类,干扰素受体分为:结合I型干扰素的I型干扰素受体和结合II型干扰素受体。人I型干扰素受体基因定位于第21号染色体上,分布于细胞表面,至少含有两个亚单位,命名为α(IFNAR-1)和β(IFNAR-2),它们属于II类细胞因子受体家族。IFN-α/β通过吸附细胞表面受体IFNAR-1和IFNAR-2发挥作用,蛋白酪氨酸激酶中的Tyk2和Jak1分别与IFNAR-1和IFNAR-2相关。
为了更好地解析IFNAR2基因的生物学功能和挖掘其在临床上的应用价值,进一步阐明IFNAR2基因的生物学功能成为必要。目前,运用RNA干扰的方法研究基因功能成为了基因功能研究中最重要的手段之一,但是针对IFNAR2基因干扰的研究尚未见任何指导。
RNA干扰(RNA interference,缩写为RNAi)是指一种分子生物学上由双链RNA诱发的基因沉默现象,其机制是通过阻碍特定基因的翻译或转录来抑制基因表达。当细胞中导入与内源性mRNA编码区同源的双链RNA时,该mRNA发生降解而导致基因表达沉默。与其它基因沉默现象不同的是,在植物和线虫中,RNAi具有传递性,可在细胞之间传播,此现象被称作系统性RNA干扰(systemic RNAi)。在秀丽隐杆线虫上实验时还可使子一代产生基因突变,甚到于可用喂食细菌给线虫的方式让线虫得以产生RNA干扰现象。RNAi现象在生物中普遍存在。RNAi所诱导的特异性基因沉默现象,是真核生物中存在的一种抗病毒入侵、抑制转座子活动、调控基因表达的监控机制,具有重大生物学意义。
RNA干扰作用是通过一类较稳定的中间介质实现的。对植物的研究证明,双链RNA复合体先降解成为35nt左右的小RNA分子,然后他们通过序列互补与mRNA结合,从而导致mRNA降解。对果蝇的研究证明,长度为21~23nt的小RNA分子是引起RNA干扰现象的直接原因。这种小RNA分子被称之为小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)。目前获得siRNA产物的方法主要包括以下五种:1)化学合成;2)体外转录;3)RNase III降解dsRNA;4)siRNA表达载体;5)PCR表达框。在以上方法中,化学合成、体外转录和RNase III降解dsRNA均是在体外制备得到siRNA,siRNA需要进入细胞后才能对蛋白的表达进行抑制,因此将siRNA转染进入细胞是成功的关键。siRNA表达载体可以在克隆菌株中大量扩增,还可以使用常规的质粒DNA转染方法,将siRNA表达载体转染入细胞,在细胞内加工生成siRNA。而且siRNA表达载体是唯一可以进行长期研究的方法,因该方法中克隆到的带抗生素标记的载体可以在细胞中持续表达,进而抑制靶基因的表达,持续时间久,并且可以做稳定细胞系的筛选。
发明内容
为了克服现有技术的缺点与不足,本发明的首要目的在于提供靶向IFNAR2基因的siRNA。本发明通过大量筛选和实验工作得到靶向IFNAR2基因的siRNA。
本发明的另一目的在于提供表达siRNA的表达载体。
本发明的另一目的在于提供上述表达载体的构建方法。
本发明的再一目的在于提供上述siRNA及表达载体在抑制IFNAR2基因表达中的应用。
本发明的目的通过下述技术方案实现:靶向IFNAR2基因的siRNA,其编码所述siRNA的DNA序列选自如下核苷酸序列:
siE1:5′-CTAACAGATGTGTGGATAA-3′(SEQ ID No.7);
siE2:5′-CGAATAAAGGGAAACATCA-3′(SEQ ID No.8);
siE3:5′-GATGAATCTTGCACTTTAA-3′(SEQ ID No.9);
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