[发明专利]一种快速从牛羊液态奶和奶粉等奶制品中高效提取DNA的方法有效
申请号: | 201410161751.1 | 申请日: | 2014-04-21 |
公开(公告)号: | CN103882012A | 公开(公告)日: | 2014-06-25 |
发明(设计)人: | 步迅;张全芳;刘艳艳 | 申请(专利权)人: | 山东省农业科学院生物技术研究中心 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 250100 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 牛羊 液态奶 奶粉 奶制品 高效 提取 dna 方法 | ||
1.一种快速从牛羊液态奶及奶粉中提取DNA方法,首次采用Chelex-100加热释放DNA结合玻璃奶纯化办法进行基因组DNA的提取,其特征在于以下步骤:
步骤一,离心管准备:采用2ml离心管,在高压灭菌锅中进行灭菌,备用;
步骤二,白细胞收集
①取牛或羊液态奶1-2ml,或者奶粉2mg溶于2ml无菌水中,将样品于2500r/mln,4℃离心30分钟;
②用小勺刮去离心管的上层乳脂和中间层乳液,保留其底部沉淀,向底部加lmLPH值7.4高压灭菌的PBS溶液,将底部沉淀吹打悬浮并转移至1.5mL的离心管中,在3500rpm/min,常温下离心10分钟,弃去上层液体,保留底部沉淀,重复3次;
步骤三,体细胞消化:向体细胞沉淀中加入5-10%的Chelex-100悬浮液280μL及20mg/ml蛋白酶K20μL,56℃保温30min以上;
步骤四,核酸释放:高速震荡5-10s,100℃煮沸8min;高速震荡5-10s,13000rpm/min离心3min,将上清转移至离心柱中,10000rpm/min离心1min,收集液体;
步骤五,核酸纯化:
1)向收集液体中加入GlassMilk5-10μL和900μL的gDNABinding Buffer,充分混匀,65°水浴15min,中间要反转几次;
2)室温放置5min,中间反转几次;4000rpm离心1min,弃上清,留管底沉淀;
3)70%酒精500ul洗涤8000rpm/min离心1min,重复此步骤2次;
4)加入500μL无水乙醇,吹打悬浮,洗涤8000rpm/min离心1min,弃上清;
5)8000rpm/min离心30S,用10μL枪头吸走残余液体,37°烘干箱放置5min直至完全干为止;
6)加100μLTE,pH7.0,60℃水浴5min溶解DNA,8000rpm/min离心5s,吸取上清转移至新的离心管中,-20℃保存备用。
步骤六,DNA质量检测:用Nanodrop紫外分光光度计检测DNA浓度及纯度;
步骤七,特异性基因的选择:选择16SrDNA基因作为研究对象,在GeneBank中查找该基因序列,设计牛或羊的特异性通用引物;
步骤八,PCR扩增及测序:选择合适的PCR体系和反应条件,进行PCR扩增,对其产物使用PCR纯化试剂盒进行纯化,测序;
步骤九,基因比对:将测序所得基因序列,进入NCBI数据库中Blast比对,进行后续的分子生物学分析;
2.根据权利要求1所述的PBS溶液配制如下:
分别称取NaCL8g,KCL0.2g,Na2HPO41.44g,K2HPO40.24g,将各种物质溶解于800mL双蒸水中,调pH至7.4,加双蒸水定容体积至1L。
3.根据权利要求1所述5-10%的Chelex-100悬浮液配制如下:
称取Chelex-1005-10g,溶于95-90ml的双蒸水中,用时充分摇匀。
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