[发明专利]从富含脂肪的组织中提取mRNA的方法在审
申请号: | 201410086548.2 | 申请日: | 2014-03-10 |
公开(公告)号: | CN103820433A | 公开(公告)日: | 2014-05-28 |
发明(设计)人: | 丁雪;王棪;孔晓敏 | 申请(专利权)人: | 北京诺禾致源生物信息科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 吴贵明;张永明 |
地址: | 100083 北京市海*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 富含 脂肪 组织 提取 mrna 方法 | ||
技术领域
本发明涉及分子生物学技术领域,具体而言,涉及一种从富含脂肪的组织中提取mRNA的方法。
背景技术
总RNA的提取是分子生物学的基本内容之一,高质量的RNA是进行基因克隆、基因表达、基因功能分析等研究的必要前提。RT-PCR、Real-Time PCR、Northern、cDNA文库构建等分子生物学研究的开展首先必须获得纯度高、完整性好的总RNA。总RNA的质量如何是通过安捷伦2100芯片生物分析仪来判定的,该分析仪已被证明可替代费时费力的凝胶电泳技术,可以提供快速自动化的高品质数字化数据,用RNA完整数(RIN)来表示。对于动物组织来说,当RIN值达到7.0时才能满足后续建库要求。脂肪组织是一个重要的内分泌器官,它参与机体的多种生理生化代谢,动物脂肪组织的研究对脂肪组织生长发育、肉品质等具有重要意义。脂肪组织单位体积细胞数较少,且单位细胞内的总RNA含量也相对较少(Mersmann,Harry J.Seminars in Plastic Srugery,2002,16(2):195~197),这增加了从脂肪组织中提取总RNA的难度。
目前,提取脂肪组织的方法有Trizol和一些试剂盒的方法,但是直接按照试剂盒说明书操作提取的总RNA效果并不理想。于是人们对试剂盒和Trizol方法进行了改进,改进之后能较好的提取总RNA(吴江维,杨公社,孙超.脂肪组织RNA提取方法的改进[J].生物技术通报,2005,5:75-77,81)。但在实验过程中发现,用上述改进的Trizol方法提取出的牛肠脂总RNA并不能满足后续的转录组建库要求。因此,亟需开发出一种提取牛肠脂mRNA的方法以满足后续的转录组建库要求。
发明内容
本发明旨在提供一种从富含脂肪的组织中提取mRNA的方法,以解决现有技术中从富含脂肪的组织中提取的mRNA不能满足转录组建库要求的技术问题。
为了实现上述目的,根据本发明的一个方面,提供了一种从富含脂肪的组织中提取mRNA的方法。该方法包括以下步骤:S1,取富含脂肪的组织,采用Trizol法获得总RNA溶液;S2,采用RNA纯化柱对总RNA溶液进行纯化,得到mRNA。
进一步地,Trizol法为吴江维改进的Trizol法。
进一步地,富含脂肪的组织为牛肠脂。
进一步地,S1包括:对牛肠脂进行匀浆、裂解、离心去除油脂、氯仿抽提、异丙醇沉淀、乙醇清洗和沉淀溶解,得到总RNA溶液。
进一步地,S1包括:在液氮中将牛肠脂研磨成粉末,向牛肠脂中加入Trizol,并震荡混匀后静置;离心去除油脂,用氯仿对获得的上清液进行抽提后,用异丙醇进行沉淀,将得到的沉淀用75%乙醇进行洗涤后用水溶解,得到总RNA溶液。
进一步地,S1包括:S11,取液氮速冻的牛肠脂,在液氮中将牛肠脂研磨成粉末,取100~150mg牛肠脂放入装有1.5ml Trizol的第一离心管中,将牛肠脂与Trizol震荡混匀后,在室温下静置10min;S12,将第一离心管在4℃,12000rpm,离心10min,离心后去除上层油脂,将下层液体转入第二离心管,离心5min,去除上层油脂,将下清液转入第三离心管中;S13,向第三离心管中加入300μl氯仿,在漩涡振荡器上振荡混匀,室温静置3~5min,自然分相;然后将第三离心管在4℃,12000rpm离心10min;将上清液转入第四离心管,加入与上清液等体积的氯仿,漩涡振荡器上振荡混匀,室温静置3~5min,自然分相,然后将第四离心管在4℃,12000rpm离心10min;S14,取第四离心管中的上清液到第五离心管中,加入与第五离心管中的上清液等体积的异丙醇,混匀后置于-80℃中放置20min,然后4℃,12000rpm离心15min;去除上清液,得到沉淀;S15,用体积百分比为75%乙醇清洗步骤S14中得到的沉淀2次,离心2min,用枪头吸取乙醇,置于室温干燥5~10min,用100μl DEPC处理过的水彻底溶解沉淀,得到总RNA溶液。
进一步地,75%乙醇是由7.5体积份无水乙醇和2.5体积份DEPC处理过的ddH2O配制而成。
进一步地,DEPC处理过的ddH2O为将0.1体积份DEPC加入99.9体积份ddH2O中涡旋混匀过夜(此处过夜为生物学中通常所说的过夜,一般是12~16小时)再经高温高压灭菌得到的水。
进一步地,S2为采用天根RNA纯化试剂盒对总RNA溶液进行纯化。
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