[发明专利]一种获得中华大节竹SOS1逆向转运蛋白编码基因序列的方法在审

专利信息
申请号: 201410010130.3 申请日: 2014-01-10
公开(公告)号: CN103773778A 公开(公告)日: 2014-05-07
发明(设计)人: 王澍;樊国盛;段晓梅;彭建松;林开文;区智 申请(专利权)人: 西南林业大学
主分类号: C12N15/29 分类号: C12N15/29;C12N15/10
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 650000 *** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 一种 获得 中华 大节 sos1 逆向 转运 蛋白 编码 基因 序列 方法
【权利要求书】:

1.一种获得中华大节竹SOS1逆向转运蛋白编码基因序列的方法,其特征在于,该获得中华大节竹SOS1逆向转运蛋白编码基因序列的方法包括以下步骤:

步骤一,提取中华大节竹幼苗的根、茎和叶的总RNA,混合RNA后,反转录合成第1链cDNA;

步骤二,用拟南芥和水稻等模式植物的SOS1基因序列,根据保守区域的序列设计简并引物IsSOS1-F1和IsSOS1-R1,以反转录合成第1链cDNA为模板,进行PCR扩增;

步骤三,PCR加样总体系为50μL:cDNA模板为1.0μL,上和下游引物10μmol/L分别为1μL,10×Buffer Mg2+为5μL,dNTPs Mixture10mmol/L为4μL,ExTaq DNA聚合酶5U/μL为0.5μL,最后补37.5μL的灭菌水;通过PCR的扩增,获得了700bp的中间片段;

步骤四,利用SMARTTM RACE cDNA Amplification Kit试剂盒中已知的引物,根据中间片段设计特异引物IsSOS1-3′和IsSOS1-5′,分别进行3′RACE和5′RACE的扩增,通过巢式PCR分别获得3′和5′片段;

步骤五,用Vector NTI12软件拼接中间、3′和5′片段,拼接出IsSOS1基因全长cDNA序列,根据拼接出的全长序列,设计特异引物IsSOS1-F2和IsSOS1-R2通过PCR扩增,PCR扩增后获得含有IsSOS1基因全长编码框的cDNA序列。

2.如权利要求1所述的获得中华大节竹SOS1逆向转运蛋白编码基因序列的方法,其特征在于,在cDNA序列包含3105bp的开放阅读框,同时编码1035个氨基酸残基,序列含有起始密码子ATG和终止密码子TGA。

3.如权利要求1所述的获得中华大节竹SOS1逆向转运蛋白编码基因序列的方法,其特征在于,该获得中华大节竹SOS1逆向转运蛋白编码基因序列的全长为3516bp,开放读码框为3105bp,编码了1035个氨基酸多肽。

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