[发明专利]一种草菇菌株0229分子特异性检测标记及其检测方法有效
申请号: | 201310643580.1 | 申请日: | 2013-12-03 |
公开(公告)号: | CN103834641B | 公开(公告)日: | 2017-10-31 |
发明(设计)人: | 汪虹;王莹;陈明杰;鲍大鹏;冯爱萍 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所31233 | 代理人: | 黄志达 |
地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 草菇 菌株 0229 分子 特异性 检测 标记 及其 方法 | ||
1.一种草菇菌株0229分子特异性检测标记,其特征在于:所述特异性检测标记为特异性引物,其中引物序列为:
F:CTTTCAGGAAGAGCCCAGC;
R:TGAAGGGCTTGAAGGAGAAA。
2.一种草菇菌株0229分子特异性检测方法,包括:
(1)将草菇菌株接种PDA平板培养基,32℃培养5d,将表面菌丝装入无菌管中,-70℃保存,然后用改进的CTAB法提取基因组DNA,得到DNA;
(2)将上述DNA为模板,特异性检测标记引物为扩增引物,进行PCR扩增,得到PCR扩增产物,进行电泳检测,其中特异性检测标记引物为F:CTTTCAGGAAGAGCCCAGC;R:TGAAGGGCTTGAAGGAGAAA;草菇菌株0229能在分子量200bp-300bp之间扩增出2条特异条带,其它草菇菌株不能在相同位置同时扩增出这2条条带。
3.根据权利要求2所述的一种草菇菌株0229分子特异性检测方法,其特征在于:所述步骤(2)中PCR扩增体系为:总体积为25μL,其中10×PCR buffer II(Mg2+Plus)2.5μL,2.5mM dNTP各2uL,5U/μL ExTaq DNA酶0.25μL,10μmol/L特异性引物对各0.5μL,50ng/μL模板DNA 0.5μL,ddH2O 18.75μL。
4.根据权利要求2所述的一种草菇菌株0229分子特异性检测方法,其特征在于:所述步骤(2)中PCR反应条件为:95℃预变性5min;95℃变性30s,54℃退火30s,72℃延伸30s,共35个循环;72℃补平10min。
5.根据权利要求2所述的一种草菇菌株0229分子特异性检测方法,其特征在于:所述步骤(2)中电泳检测方法为:取PCR扩增产物20μL,与12μL加样缓冲液混匀,于95℃变性5分钟,结束后置于冰水混合物中冷却3分钟,点样3μL与6%变性聚丙烯酰胺上电泳,电泳缓冲液为1×TBE,电压1000V,电流200mA,功率200W,电泳45分钟,银染,显色,然后在凝胶成像仪上拍照。
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